29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0079 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  763    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  96.76 
 
 
370 aa  743    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  74.59 
 
 
370 aa  594  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  29.46 
 
 
361 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  28.84 
 
 
364 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  27.57 
 
 
361 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  27.64 
 
 
381 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  25.84 
 
 
388 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  26.93 
 
 
381 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  24.81 
 
 
388 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  25.39 
 
 
373 aa  89.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  22.56 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  23.73 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0329  hypothetical protein  22.91 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  20.92 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  24.5 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  24.81 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4586  hypothetical protein  21.69 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48591  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  24.5 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  23.66 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  37 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  22.68 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  20.41 
 
 
373 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  20 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  19.79 
 
 
485 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  23.13 
 
 
389 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  21.01 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  20.72 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  23.3 
 
 
383 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>