269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0067 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0067  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  342  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0072  hypothetical protein  98.8 
 
 
166 aa  339  9e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  72.73 
 
 
166 aa  262  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  39.38 
 
 
152 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  39.38 
 
 
152 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  43.12 
 
 
153 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  38.75 
 
 
151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  40.62 
 
 
172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  38.12 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  38.12 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  38.12 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  38.12 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  42.5 
 
 
150 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  42.5 
 
 
150 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  38.89 
 
 
173 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  42.5 
 
 
150 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  38.27 
 
 
161 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  42.5 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  38.12 
 
 
151 aa  111  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  36.36 
 
 
151 aa  111  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  38.75 
 
 
153 aa  110  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  36.88 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  40.26 
 
 
151 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  38.27 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  40.26 
 
 
151 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  40.26 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  37.27 
 
 
165 aa  107  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  41.25 
 
 
154 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  41.25 
 
 
154 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  38.27 
 
 
158 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  36.25 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  40.62 
 
 
150 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  40.62 
 
 
150 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  40.62 
 
 
150 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  40.62 
 
 
150 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  40.62 
 
 
150 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  38.75 
 
 
152 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  40.62 
 
 
150 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  37.01 
 
 
151 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  36.25 
 
 
151 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  36.88 
 
 
152 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  37.04 
 
 
169 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  40.13 
 
 
162 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  35.8 
 
 
169 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  35.8 
 
 
169 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  39.51 
 
 
191 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  35.67 
 
 
157 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  36.65 
 
 
151 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  39.38 
 
 
150 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  40 
 
 
140 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  39.38 
 
 
150 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  40.67 
 
 
140 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  39.38 
 
 
150 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  39.38 
 
 
150 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  40.67 
 
 
140 aa  101  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  38.75 
 
 
150 aa  101  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.95 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  36.6 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  33.12 
 
 
151 aa  97.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  97.1  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  35.06 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  39.33 
 
 
145 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  35.95 
 
 
152 aa  95.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  36.26 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  33.55 
 
 
176 aa  94.4  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  36.02 
 
 
172 aa  94.4  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  36.36 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  33.77 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  35.46 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  32.26 
 
 
150 aa  86.3  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  32.69 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  33.99 
 
 
154 aa  85.1  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  30.72 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  30.07 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  29.19 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2516  hypothetical protein  31.84 
 
 
226 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  34.21 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  28.15 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0177  hypothetical protein  30.86 
 
 
199 aa  79  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.020604  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0201  hypothetical protein  30.86 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0967046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  29.75 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  29.33 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  29.88 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0250  protein of unknown function DUF150  29.25 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  28.3 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  32.92 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  27.67 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  27.27 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>