More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0065 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0065  triosephosphate isomerase  100 
 
 
269 aa  554  1e-157  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.914052  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0070  triosephosphate isomerase  84.01 
 
 
269 aa  480  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626073  normal  0.320035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0152  Triose-phosphate isomerase  48.13 
 
 
265 aa  257  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  42.69 
 
 
251 aa  184  1e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.08196e-06  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  42.31 
 
 
251 aa  181  8e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.00734e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  42.31 
 
 
251 aa  181  8e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  41.92 
 
 
251 aa  180  3e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  41.92 
 
 
251 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  41.54 
 
 
251 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  7.85898e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  41.54 
 
 
251 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  41.22 
 
 
252 aa  174  1e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  38.43 
 
 
250 aa  174  1e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  40.93 
 
 
251 aa  173  2e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.60979e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  39.7 
 
 
245 aa  172  4e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  39.77 
 
 
266 aa  172  6e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  41.73 
 
 
256 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  40.3 
 
 
245 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  39.33 
 
 
245 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  36.02 
 
 
250 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  40.93 
 
 
251 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  39.77 
 
 
250 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  40.15 
 
 
251 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  39.85 
 
 
255 aa  166  3e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  37.26 
 
 
252 aa  166  3e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  39.77 
 
 
266 aa  166  3e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  39.77 
 
 
251 aa  166  3e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  39.77 
 
 
266 aa  166  3e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  40.23 
 
 
255 aa  166  3e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  39.77 
 
 
266 aa  166  3e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  39.77 
 
 
266 aa  166  3e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  36.36 
 
 
249 aa  165  7e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  35.98 
 
 
246 aa  165  7e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  36.78 
 
 
257 aa  165  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  39.31 
 
 
248 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  38.81 
 
 
253 aa  165  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  164  2e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  164  2e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  164  2e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  164  2e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  38.58 
 
 
257 aa  163  2e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  39.08 
 
 
255 aa  164  2e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  164  2e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  164  2e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  164  2e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  164  2e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  39.46 
 
 
255 aa  163  2e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  34.98 
 
 
251 aa  163  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  37.88 
 
 
255 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  39.69 
 
 
255 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  37.88 
 
 
255 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  39.23 
 
 
254 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  40.61 
 
 
255 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  37.88 
 
 
255 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  39.38 
 
 
251 aa  162  4e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  40.23 
 
 
253 aa  162  4e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  162  4e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  162  4e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  162  4e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  39.69 
 
 
271 aa  162  4e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  39.15 
 
 
248 aa  162  4e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 
255 aa  162  4e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  39.18 
 
 
261 aa  162  5e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  36.84 
 
 
250 aa  162  5e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  37.22 
 
 
250 aa  162  5e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  39.55 
 
 
257 aa  162  5e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  37.45 
 
 
251 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.40949e-14  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  38.64 
 
 
254 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  37.16 
 
 
249 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  39.23 
 
 
251 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  2.15074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  38.76 
 
 
248 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  37.31 
 
 
259 aa  162  8e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  38.02 
 
 
252 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0169  triosephosphate isomerase  36.12 
 
 
256 aa  160  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  37.79 
 
 
248 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  35.58 
 
 
255 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  38.85 
 
 
246 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  36.68 
 
 
258 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  40.91 
 
 
250 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  37.16 
 
 
247 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  36.68 
 
 
259 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  38.37 
 
 
248 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  39.41 
 
 
245 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  37.02 
 
 
254 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  35.29 
 
 
257 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  38.61 
 
 
255 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  39.77 
 
 
250 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  38.91 
 
 
252 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  38.46 
 
 
251 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  38.07 
 
 
240 aa  156  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  37.65 
 
 
251 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  37.5 
 
 
253 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  37.12 
 
 
252 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  6.11161e-06  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  35.82 
 
 
253 aa  155  5e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  36.4 
 
 
254 aa  155  5e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  37.93 
 
 
251 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  37.02 
 
 
256 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  36.94 
 
 
249 aa  155  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  36.12 
 
 
251 aa  155  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  37.74 
 
 
253 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>