91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0059 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0059  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  230  5e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0064  hypothetical protein  97.3 
 
 		 111 aa  225  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.268417  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0146  hypothetical protein  69.81 
 
 		 110 aa  161  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2762  hypothetical protein  44.04 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4431  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4545  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593261  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3823  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1300  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5759  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4104  hypothetical protein  42.45 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1207  hypothetical protein  43.4 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3969  hypothetical protein  42.45 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.539979  normal  0.0411996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1707  hypothetical protein  41.12 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.224011  hitchhiker  0.00197735 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1372  hypothetical protein  42.59 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1403  hypothetical protein  45.79 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2901  hypothetical protein  42.45 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.649398  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6412  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6718  protein of unknown function DUF1255  40.74 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.042876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3029  hypothetical protein  42.45 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.249045  normal  0.859497 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2232  protein of unknown function DUF1255  39.81 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2742  hypothetical protein  39.81 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.156503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1857  hypothetical protein  41.28 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1848  hypothetical protein  42.06 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.711654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1338  hypothetical protein  39.42 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.73825e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2688  hypothetical protein  35.78 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0281  hypothetical protein  40.74 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4838  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  84.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1534  hypothetical protein  39.42 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1083  hypothetical protein  39.29 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2828  protein of unknown function DUF1255  37.96 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.948708  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2422  protein of unknown function DUF1255  37.96 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0761  protein of unknown function DUF1255  39.81 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.827861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2672  protein of unknown function DUF1255  38.32 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4775  hypothetical protein  36.11 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1951  protein of unknown function DUF1255  36.79 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1328  hypothetical protein  36.11 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1600  hypothetical protein  35.71 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2227  hypothetical protein  33.96 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000123767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2552  hypothetical protein  34.26 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.271143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0913  hypothetical protein  37.62 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1752  hypothetical protein  37.74 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0748694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1187  protein of unknown function DUF1255  35.85 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0389162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3372  hypothetical protein  36.54 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3765  protein of unknown function DUF1255  38.83 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3074  protein of unknown function DUF1255  34.91 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1778  hypothetical protein  34.26 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0253213  normal  0.0734741 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000961266 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2102  hypothetical protein  33.98 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3424  hypothetical protein  31 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.310921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0379  hypothetical protein  33 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0262  hypothetical protein  32 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4467  hypothetical protein  32 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3759  hypothetical protein  32 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0273  hypothetical protein  33 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0265  hypothetical protein  33 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1472  hypothetical protein  38.1 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0269  protein of unknown function DUF1255  32 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0273  hypothetical protein  32 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0323  hypothetical protein  28.71 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0338978  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1508  protein of unknown function DUF1255  31.07 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3590  protein of unknown function DUF1255  32.94 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.3016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3522  protein of unknown function DUF1255  31.76 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0560507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3497  hypothetical protein  31.76 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0308826  normal  0.95157 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000943  hypothetical protein  36.11 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.597764  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0270  hypothetical protein  30.11 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2513  hypothetical protein  30.34 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195334  normal  0.450057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1700  hypothetical protein  31.75 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00119422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2532  hypothetical protein  30 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608768 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0656  hypothetical protein  29.07 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2862  hypothetical protein  28.89 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0415789  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0861  hypothetical protein  28.89 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128749  hitchhiker  0.0000846912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3281  hypothetical protein  32.2 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3292  hypothetical protein  32.2 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.739881  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3142  hypothetical protein  32.2 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.496899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3196  hypothetical protein  30 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310619  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0862  hypothetical protein  36.21 
 
 		 95 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325253  normal  0.891406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44140  hypothetical protein  28.09 
 
 		 93 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0403  hypothetical protein  24.27 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29860  hypothetical protein  28.89 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.640265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0567  hypothetical protein  24.27 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3814  hypothetical protein  27.78 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1594  Fatty acid synthesis plsX protein  32.2 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000298358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0015  hypothetical protein  26.97 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0998  hypothetical protein  30.51 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.239869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3312  hypothetical protein  30.51 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1620  hypothetical protein  27.78 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4248  hypothetical protein  27.78 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3567  hypothetical protein  29.67 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1547  hypothetical protein  30.14 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02857  hypothetical protein  30 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>