112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0048 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  301  2e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  95.45 
 
 
154 aa  288  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  73.51 
 
 
183 aa  228  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  75.17 
 
 
149 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  74.5 
 
 
149 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  74.5 
 
 
149 aa  223  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  73.79 
 
 
149 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  73.97 
 
 
163 aa  215  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  69.17 
 
 
151 aa  181  4e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  57.14 
 
 
160 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  41.61 
 
 
144 aa  114  4e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  41.18 
 
 
144 aa  100  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  39.26 
 
 
144 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  39.26 
 
 
144 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  42.19 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  33.79 
 
 
146 aa  82.8  1e-15  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  35.56 
 
 
145 aa  82.4  2e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.97964e-15  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  37.98 
 
 
162 aa  80.9  7e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 
146 aa  80.5  8e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  30.71 
 
 
142 aa  80.1  9e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1459  protein of unknown function DUF606  40 
 
 
149 aa  79.7  1e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0049  hypothetical protein  35.25 
 
 
144 aa  77.4  6e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0539536  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  32.03 
 
 
142 aa  76.3  2e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1328  hypothetical protein  35.25 
 
 
144 aa  75.5  3e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  33.59 
 
 
145 aa  74.7  4e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.15234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  28.24 
 
 
145 aa  72  3e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  31.03 
 
 
148 aa  66.2  2e-10  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  29.37 
 
 
145 aa  62  3e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  28.76 
 
 
172 aa  61.6  4e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  27.82 
 
 
143 aa  61.2  5e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  24.81 
 
 
147 aa  59.3  2e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.16993e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  29.11 
 
 
318 aa  59.3  2e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  31.29 
 
 
147 aa  58.5  3e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  29.5 
 
 
148 aa  58.5  3e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  36.72 
 
 
147 aa  58.2  4e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  57.8  6e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  34.68 
 
 
151 aa  57.8  6e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  36.44 
 
 
144 aa  57.8  6e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  31.88 
 
 
149 aa  56.6  1e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  30.65 
 
 
148 aa  55.5  2e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  25 
 
 
297 aa  55.8  2e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  33.08 
 
 
146 aa  54.7  4e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  34.07 
 
 
184 aa  54.3  6e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  29.66 
 
 
146 aa  53.9  8e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  29.5 
 
 
149 aa  53.5  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  28.68 
 
 
147 aa  52.4  2e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  34.95 
 
 
178 aa  51.6  3e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2936  hypothetical protein  31.15 
 
 
143 aa  52  3e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  27.89 
 
 
151 aa  52.4  3e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2619  hypothetical protein  30.33 
 
 
143 aa  51.2  4e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  31.69 
 
 
164 aa  51.6  4e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  30.88 
 
 
146 aa  50.8  7e-06  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  50.4  8e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  29.66 
 
 
174 aa  50.4  8e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  24.62 
 
 
147 aa  50.1  1e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  30.47 
 
 
147 aa  49.3  2e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  28.24 
 
 
137 aa  49.7  2e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  24.82 
 
 
309 aa  48.5  3e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  30.3 
 
 
156 aa  48.5  3e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  24.82 
 
 
309 aa  48.5  3e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  30.83 
 
 
148 aa  48.9  3e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  31.39 
 
 
147 aa  47.4  7e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0520  protein of unknown function DUF606  23.64 
 
 
138 aa  47.4  8e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000146462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2420  hypothetical protein  23.48 
 
 
157 aa  47  9e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  32.43 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2369  hypothetical protein  23.97 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2963  hypothetical protein  24.79 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.41688  normal  0.045431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  31.58 
 
 
148 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  30.83 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  31.68 
 
 
317 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  26.24 
 
 
307 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  30.94 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  29.37 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  30.22 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  24.49 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  31.03 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  30.83 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1692  hypothetical protein  24.77 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.191428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  28.36 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  31.09 
 
 
318 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  30.25 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  24.49 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  29.07 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  25.35 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  29.92 
 
 
335 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  30.85 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  28.89 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  30.47 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  24.49 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1952  hypothetical protein  27.91 
 
 
145 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00709257  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  31.43 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  32.76 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  30.77 
 
 
172 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  30.16 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0521  protein of unknown function DUF606  24.11 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00661501  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  31.43 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  29.03 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  28.81 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3483  hypothetical protein  27.87 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>