244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0046 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0046  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  815    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0054  permease YjgP/YjgQ  91.18 
 
 
408 aa  727    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0055  permease YjgP/YjgQ family protein  56.15 
 
 
449 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.853634  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  31.59 
 
 
355 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  31.07 
 
 
355 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  31.84 
 
 
353 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  31.32 
 
 
353 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  29.55 
 
 
353 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  31.84 
 
 
354 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  28.68 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  31.4 
 
 
353 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  31.4 
 
 
353 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  31.4 
 
 
353 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  30.61 
 
 
353 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  30.53 
 
 
354 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  30.63 
 
 
353 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  29.95 
 
 
353 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  32.37 
 
 
353 aa  162  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  27.27 
 
 
356 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  29.74 
 
 
356 aa  149  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  27.49 
 
 
356 aa  145  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  27.39 
 
 
353 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  26.49 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  25.71 
 
 
358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  26.23 
 
 
356 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  28.74 
 
 
352 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  27.11 
 
 
353 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  27.01 
 
 
356 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  25.76 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  26.22 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  27.25 
 
 
358 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  27.25 
 
 
358 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  27.25 
 
 
358 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  25.58 
 
 
355 aa  133  6e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  25.84 
 
 
355 aa  132  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  27.56 
 
 
352 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 
357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  27.44 
 
 
354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  25.72 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  27.01 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  26.7 
 
 
358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  26.44 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  27.65 
 
 
356 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  26.68 
 
 
356 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  29.03 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  26.11 
 
 
351 aa  121  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  26.43 
 
 
358 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  26.3 
 
 
360 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  26.67 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  26.04 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  26.03 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  26.3 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  26.3 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  26.3 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  26.3 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  26.3 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  26.3 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  27.13 
 
 
356 aa  119  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 
352 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  24.85 
 
 
352 aa  119  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  24.38 
 
 
370 aa  116  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.16 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  24.2 
 
 
352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  25.26 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  25.26 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  25.26 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  25.26 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  25.26 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 
360 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 
376 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  24.54 
 
 
368 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  26.34 
 
 
353 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  22.33 
 
 
401 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  22.5 
 
 
397 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  22.75 
 
 
397 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  21.72 
 
 
383 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 
386 aa  102  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  22.94 
 
 
387 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  20.34 
 
 
369 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  27.06 
 
 
350 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  20.34 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0403  permease YjgP/YjgQ  28.87 
 
 
354 aa  97.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0309466  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0621  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 
384 aa  97.1  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185223  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  22.65 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1375  permease YjgP/YjgQ family protein  26.39 
 
 
357 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0538  permease YjgP/YjgQ family protein  23.72 
 
 
368 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0426669  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  20.24 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1013  hypothetical protein  22.4 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0821  hypothetical protein  22.28 
 
 
383 aa  88.2  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  19.05 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>