More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0039 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0039  heat shock protein DnaJ  100 
 
 
332 aa  667    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  92.47 
 
 
330 aa  586  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  71.39 
 
 
339 aa  457  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  41.54 
 
 
315 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.26 
 
 
331 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  40.31 
 
 
313 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  39.69 
 
 
315 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  39.63 
 
 
320 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  42.2 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.21 
 
 
315 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.31 
 
 
313 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.31 
 
 
341 aa  219  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.96 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.59 
 
 
331 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  37.35 
 
 
327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.31 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  38.48 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  42.01 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  37.72 
 
 
326 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.72 
 
 
325 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  37.39 
 
 
326 aa  203  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  37.31 
 
 
313 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.96 
 
 
326 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.39 
 
 
323 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.47 
 
 
317 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.39 
 
 
319 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  36.39 
 
 
306 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  36.09 
 
 
306 aa  189  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  38.51 
 
 
318 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  35.78 
 
 
306 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  35.78 
 
 
306 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  35.78 
 
 
306 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  35.78 
 
 
306 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  35.78 
 
 
306 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  35.78 
 
 
306 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  37.23 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.14 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  35.47 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  37.79 
 
 
304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.95 
 
 
324 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  40.48 
 
 
319 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.48 
 
 
319 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  40.48 
 
 
314 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  37.04 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  34.35 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  34.66 
 
 
306 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  34.66 
 
 
306 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  34.66 
 
 
306 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  34.66 
 
 
306 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  34.66 
 
 
306 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.88 
 
 
318 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  39.05 
 
 
314 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  38.51 
 
 
313 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  34.15 
 
 
313 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.36 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  35.21 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  36.5 
 
 
307 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.28 
 
 
347 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  37.96 
 
 
310 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  37.96 
 
 
310 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0647  chaperone DnaJ domain protein  39.12 
 
 
337 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  37.08 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  36.45 
 
 
314 aa  165  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  34.53 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  35.49 
 
 
315 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  32.57 
 
 
330 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  31.94 
 
 
335 aa  162  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  34.34 
 
 
294 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  34.65 
 
 
297 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  33.54 
 
 
324 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  32.82 
 
 
287 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  33.01 
 
 
304 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  31.04 
 
 
311 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  37.35 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.15 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  34.56 
 
 
309 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.85 
 
 
291 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.23 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  32.13 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1433  DnaJ protein  33.03 
 
 
293 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  31.4 
 
 
333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1364  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.42 
 
 
293 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  36.7 
 
 
316 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  31.83 
 
 
319 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  34.76 
 
 
299 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  29.83 
 
 
373 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  33.63 
 
 
311 aa  149  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0976  co-chaperone protein DnaJ  34.08 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  35.47 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  31.19 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.85 
 
 
351 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.28 
 
 
323 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  29.01 
 
 
370 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  31.27 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  30.21 
 
 
333 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  30.98 
 
 
294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.89 
 
 
316 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  32.65 
 
 
323 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  30.49 
 
 
377 aa  145  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  30.52 
 
 
335 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>