More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0037 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0045  ABC transporter related  97.02 
 
 
663 aa  1314  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.919141  normal  0.873152 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  69.35 
 
 
664 aa  955  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0037  ABC transporter ATPase  100 
 
 
672 aa  1386  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.489009  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.86 
 
 
635 aa  605  1e-172  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.86 
 
 
635 aa  605  1e-172  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.71 
 
 
635 aa  603  1e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.86 
 
 
635 aa  603  1e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.86 
 
 
635 aa  603  1e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.56 
 
 
637 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.56 
 
 
637 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.56 
 
 
637 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.56 
 
 
637 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  46.56 
 
 
637 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.56 
 
 
637 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  46.56 
 
 
637 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 
651 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.56 
 
 
637 aa  599  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  3.38837e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.56 
 
 
637 aa  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  48.07 
 
 
636 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 
635 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.75 
 
 
635 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  47.32 
 
 
633 aa  588  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.81 
 
 
637 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 
638 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  47.02 
 
 
636 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.96 
 
 
639 aa  581  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.71 
 
 
637 aa  578  1e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  46.43 
 
 
636 aa  576  1e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  45.09 
 
 
636 aa  575  1e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  45.67 
 
 
633 aa  578  1e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  48.02 
 
 
636 aa  578  1e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  45.44 
 
 
637 aa  575  1e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
634 aa  573  1e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  45.44 
 
 
637 aa  575  1e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  45.44 
 
 
637 aa  574  1e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  45.09 
 
 
637 aa  574  1e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  45.09 
 
 
637 aa  573  1e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  45.09 
 
 
637 aa  573  1e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.22 
 
 
638 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 
635 aa  569  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  45.62 
 
 
639 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  46.07 
 
 
636 aa  569  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  45.92 
 
 
656 aa  571  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  44.94 
 
 
637 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  46.58 
 
 
636 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 
636 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  44.48 
 
 
636 aa  565  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  43.09 
 
 
648 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
638 aa  562  1e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  45.14 
 
 
637 aa  564  1e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  46.18 
 
 
659 aa  562  1e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  44.36 
 
 
636 aa  558  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  44.56 
 
 
650 aa  560  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  44.94 
 
 
657 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  43.39 
 
 
636 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
640 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0220  ABC transporter related  47.46 
 
 
615 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
640 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
640 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  45.43 
 
 
636 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03980  ABC transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 
650 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  44.64 
 
 
650 aa  554  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 
638 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  42.81 
 
 
635 aa  540  1e-152  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  45.02 
 
 
642 aa  537  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  42.88 
 
 
641 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  46.31 
 
 
672 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 
643 aa  531  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0581  ABC transporter related  50.09 
 
 
647 aa  529  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  43.73 
 
 
635 aa  524  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  42.75 
 
 
634 aa  521  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  41.6 
 
 
641 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  42.53 
 
 
650 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  3.25943e-05 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  43.05 
 
 
644 aa  511  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
676 aa  508  1e-142  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 
657 aa  507  1e-142  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  42.69 
 
 
692 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  42.84 
 
 
645 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  41.95 
 
 
643 aa  505  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  44.25 
 
 
624 aa  499  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  40.38 
 
 
640 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1302  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
639 aa  501  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  42.79 
 
 
643 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  41.21 
 
 
646 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
532 aa  490  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  45.44 
 
 
532 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3608  ABC transporter related  45.69 
 
 
687 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100909  normal  0.0123712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1808  ABC transporter related  42.21 
 
 
672 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.762366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2071  ABC transporter related  41.19 
 
 
656 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  40.97 
 
 
673 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1894  ABC transporter related  41.35 
 
 
656 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2338  ABC transporter related protein  44.53 
 
 
635 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1802  putative ATP-binding ABC transporter protein  47.13 
 
 
660 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235384  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1830  hypothetical protein  39.2 
 
 
616 aa  470  1e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1833  hypothetical protein  39.2 
 
 
616 aa  472  1e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1992  ABC transporter related  40.75 
 
 
678 aa  467  1e-130  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2041  ABC transporter related  41.4 
 
 
651 aa  467  1e-130  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2715  ABC transporter related  44.72 
 
 
650 aa  466  1e-130  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 
646 aa  466  1e-130  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  43.58 
 
 
630 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>