140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0034 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  100 
 
 
176 aa  351  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  98.86 
 
 
176 aa  349  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  65.88 
 
 
171 aa  238  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  47.55 
 
 
169 aa  132  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  41.83 
 
 
166 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  47.06 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  45.71 
 
 
164 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  42.5 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  40.94 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  35.85 
 
 
163 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  35.22 
 
 
163 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  38.16 
 
 
166 aa  104  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  35.85 
 
 
172 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  36.5 
 
 
168 aa  101  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  40.8 
 
 
173 aa  100  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  38.85 
 
 
163 aa  99  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  37.33 
 
 
163 aa  98.6  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  39.06 
 
 
163 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  39.2 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  37.68 
 
 
163 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  36.94 
 
 
174 aa  94.4  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  38.57 
 
 
167 aa  92.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  37.14 
 
 
168 aa  90.9  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  37.31 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  39.19 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  33.73 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  35.67 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  33.54 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  34.57 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  36.3 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  35.1 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  41.01 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  35.48 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  34.36 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  30.66 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  36.17 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  29.22 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  35.77 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  34.97 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  34.59 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  29.66 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  25.17 
 
 
172 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  34.65 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  31.39 
 
 
168 aa  61.6  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  28.66 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  28.66 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  28.66 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  28.66 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  30.18 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  28.66 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  29.87 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  28.66 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  28.66 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  28.66 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  28.66 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0058  disulfide bond formation protein DsbB  33.85 
 
 
175 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  30.95 
 
 
168 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  35.11 
 
 
168 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  25.45 
 
 
176 aa  58.2  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  33.88 
 
 
1210 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  30.43 
 
 
175 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  30.25 
 
 
178 aa  57.8  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0190  disulphide bond formation protein DsbB  34.78 
 
 
168 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  27.81 
 
 
176 aa  57.8  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  29.3 
 
 
177 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1478  disulphide bond formation protein DsbB  31.29 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  30.46 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  27.22 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  26.35 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  26.35 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  26.35 
 
 
213 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  25.3 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  24.71 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0260  disulphide bond formation protein DsbB  30.71 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1614  disulfide bond formation protein B  33.08 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  29.09 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  32.58 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0212  disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  25.56 
 
 
175 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  25.56 
 
 
175 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  24.7 
 
 
179 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  24.71 
 
 
175 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  25.54 
 
 
175 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  27.54 
 
 
176 aa  54.7  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  28.35 
 
 
171 aa  54.3  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  24.1 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0132  DsbB family protein  30.07 
 
 
175 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0714  disulfide bond formation protein B  32.62 
 
 
168 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  30.08 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  31.88 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  31.88 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  31.88 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>