More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0030 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  96.74 
 
 		 184 aa  364  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  81.76 
 
 		 176 aa  288  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  61.71 
 
 		 168 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  61.14 
 
 		 168 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  60.59 
 
 		 168 aa  208  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  65 
 
 		 167 aa  205  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  57.06 
 
 		 168 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  57.71 
 
 		 168 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  58.86 
 
 		 168 aa  201  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  57.14 
 
 		 168 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  57.14 
 
 		 168 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  56.73 
 
 		 168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  56.25 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  59.51 
 
 		 216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  59.51 
 
 		 167 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  59.51 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  59.51 
 
 		 167 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  57.41 
 
 		 169 aa  197  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  59.51 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  55.62 
 
 		 169 aa  197  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  59.51 
 
 		 167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  59.51 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  59.51 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  58.02 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  57.06 
 
 		 167 aa  194  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  57.06 
 
 		 167 aa  194  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  57.06 
 
 		 167 aa  194  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  57.06 
 
 		 181 aa  194  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  55.42 
 
 		 168 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  56.02 
 
 		 168 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  58.64 
 
 		 167 aa  193  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  56.17 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  56.17 
 
 		 171 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  55.69 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  56.44 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  56.44 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  56.44 
 
 		 167 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  51.46 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  54.94 
 
 		 168 aa  191  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  52.6 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  55.56 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  52.66 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  57.41 
 
 		 167 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  56.17 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  50.29 
 
 		 171 aa  187  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  53.18 
 
 		 170 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  53.18 
 
 		 170 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  54.39 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  55.56 
 
 		 169 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  53.99 
 
 		 167 aa  185  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  53.99 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  53.99 
 
 		 167 aa  184  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  54.22 
 
 		 167 aa  184  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  54.55 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  54.55 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  54.55 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  50 
 
 		 171 aa  181  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  53.33 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  50.88 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  53.09 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  50.29 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  50.88 
 
 		 170 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  50.88 
 
 		 170 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  48.91 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  50.88 
 
 		 170 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  54.32 
 
 		 191 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  50.88 
 
 		 170 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  50 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  51.46 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  52.35 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  51.81 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  49.71 
 
 		 169 aa  174  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  53.09 
 
 		 169 aa  174  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  49.12 
 
 		 170 aa  174  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  48.5 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  47.9 
 
 		 171 aa  174  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  52.07 
 
 		 175 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  47.9 
 
 		 171 aa  174  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  51.5 
 
 		 167 aa  174  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  53.61 
 
 		 170 aa  174  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  49.71 
 
 		 187 aa  174  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  53.61 
 
 		 170 aa  174  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  53.61 
 
 		 170 aa  174  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  51.18 
 
 		 172 aa  174  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  52.07 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  49.71 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  50.59 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  52.66 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  50.3 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  53.37 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  53.37 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  50 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  49.38 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  53.37 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  53.37 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  49.7 
 
 		 171 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  52.07 
 
 		 175 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  47.43 
 
 		 175 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  52.35 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>