More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0028 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
278 aa  560  1e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  94.57 
 
 
276 aa  527  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  70.22 
 
 
275 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  58.8 
 
 
267 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  58.8 
 
 
267 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  58.8 
 
 
267 aa  327  1e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  58.43 
 
 
267 aa  324  8e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  56.55 
 
 
267 aa  318  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  56.93 
 
 
267 aa  318  8e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  56.93 
 
 
267 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  56.34 
 
 
268 aa  312  4e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  56.55 
 
 
267 aa  307  1e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  56.34 
 
 
268 aa  305  4e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  56.34 
 
 
268 aa  304  1e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  55.26 
 
 
266 aa  303  2e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  54.72 
 
 
266 aa  303  2e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  55.13 
 
 
268 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  54.31 
 
 
267 aa  298  8e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  55.26 
 
 
268 aa  297  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  52.59 
 
 
273 aa  295  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  52.81 
 
 
273 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  52.81 
 
 
273 aa  293  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 
270 aa  293  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.95261e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  52.43 
 
 
273 aa  292  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  53.18 
 
 
273 aa  291  8e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  52.06 
 
 
273 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  53.36 
 
 
269 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  53.38 
 
 
273 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  52.81 
 
 
269 aa  289  5e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 
270 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 
270 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.10417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 
270 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  1.53005e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 
270 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.73903e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  56.18 
 
 
270 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  51.67 
 
 
273 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 
270 aa  286  3e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 
270 aa  286  3e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 
270 aa  286  3e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  53.36 
 
 
264 aa  285  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 
269 aa  285  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 
270 aa  285  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 
273 aa  284  1e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 
273 aa  284  1e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  53.01 
 
 
273 aa  284  1e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  53.93 
 
 
273 aa  284  1e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 
273 aa  282  4e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 
270 aa  281  6e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.39889e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 
269 aa  281  6e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 
271 aa  280  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 
270 aa  280  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 
268 aa  280  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  51.88 
 
 
271 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  52.26 
 
 
270 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  3.35304e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  53.33 
 
 
267 aa  279  5e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  51.88 
 
 
274 aa  278  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  52.06 
 
 
269 aa  276  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  51.69 
 
 
267 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  50.38 
 
 
271 aa  276  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  51.31 
 
 
269 aa  275  6e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  51.12 
 
 
269 aa  274  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  50.94 
 
 
273 aa  274  1e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  55.3 
 
 
267 aa  273  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 
273 aa  272  4e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 
273 aa  272  4e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  52.43 
 
 
273 aa  272  4e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  52.43 
 
 
273 aa  272  4e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  52.26 
 
 
273 aa  271  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  52.26 
 
 
273 aa  271  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  52.06 
 
 
273 aa  271  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  52.06 
 
 
273 aa  270  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  52.26 
 
 
273 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  50.56 
 
 
265 aa  268  9e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 
267 aa  267  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 
271 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  4.0359e-05  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  49.44 
 
 
268 aa  266  3e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 
265 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 
268 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 
268 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 
268 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 
268 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  49.44 
 
 
265 aa  261  7e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 
268 aa  261  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  48.69 
 
 
265 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  48.69 
 
 
268 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  48.69 
 
 
268 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  48.69 
 
 
265 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 
265 aa  258  5e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  48.31 
 
 
265 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  48.31 
 
 
265 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3383  dihydrodipicolinate reductase  49.41 
 
 
254 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.41563e-05 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  47.19 
 
 
265 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  3.25383e-07 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 
263 aa  254  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  47.94 
 
 
265 aa  254  1e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  47.94 
 
 
267 aa  254  1e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  47.57 
 
 
265 aa  254  1e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 
263 aa  253  2e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  48.12 
 
 
267 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 
267 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  50.38 
 
 
273 aa  251  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 
273 aa  249  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>