239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0023 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  412  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  88.78 
 
 		 198 aa  370  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  78.06 
 
 		 198 aa  324  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  48.15 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  47.34 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  46.94 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  47.59 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  40.54 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  40.11 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  39.08 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  41.76 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  37.43 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  36.87 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  36.87 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  38.07 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  36.87 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  41.3 
 
 		 290 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  39.66 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  42.44 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  36.9 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  41.49 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  42.05 
 
 		 194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  39.46 
 
 		 206 aa  130  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  41.48 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  43.18 
 
 		 195 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  36.61 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  40.91 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  43.18 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  39.51 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  43.18 
 
 		 303 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  43.18 
 
 		 303 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  39.51 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  43.18 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  37.22 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  43.18 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  43.03 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  43.1 
 
 		 303 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  42.13 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  39.29 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  42.05 
 
 		 195 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  42.05 
 
 		 195 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  42.13 
 
 		 195 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  42.05 
 
 		 195 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  35.43 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  38.14 
 
 		 199 aa  127  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  37.1 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  36.42 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  35.32 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  40.57 
 
 		 245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  37.82 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  38.83 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  44.29 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  33.68 
 
 		 212 aa  121  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  53.7 
 
 		 232 aa  121  6e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  39.08 
 
 		 197 aa  120  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  36.78 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  41.41 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  36.16 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  46.4 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  37.04 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  37.36 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  39.02 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  36.76 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  33.87 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  36.73 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  35.78 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  33.84 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  35.98 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  37.36 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  36.51 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  38.97 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  47.37 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  45.83 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  35.57 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  33.71 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  36.17 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  32.98 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  44.88 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  37.57 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  36.41 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  32.45 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  32.81 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  36.57 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  38.33 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  35.5 
 
 		 192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  34.29 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3648  hypothetical protein  37.5 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.987474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  35.45 
 
 		 205 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  38.89 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  30.85 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  34.41 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  33.14 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  40.31 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.1 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  45.53 
 
 		 211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  36.42 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  35.32 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  31.52 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>