19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0018 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0018  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.364832  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 608 aa  101  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05007  exonuclease  33.97 
 
 		 627 aa  99  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1227  hypothetical protein  33.82 
 
 		 592 aa  88.6  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4459  hypothetical protein  29.53 
 
 		 622 aa  71.6  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4891  hypothetical protein  29.57 
 
 		 602 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.981822 
 
 
-
 
NC_002936  DET1107  hypothetical protein  29.19 
 
 		 610 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.948524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0472  hypothetical protein  52.17 
 
 		 664 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.138177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  38.57 
 
 		 533 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19041  DNA repair protein RecN, ABC transporter  51.43 
 
 		 558 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0149908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19031  DNA repair protein RecN, ABC transporter  51.43 
 
 		 559 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1866  SMC domain-containing protein  38.81 
 
 		 531 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19221  DNA repair protein RecN, ABC transporter  51.43 
 
 		 559 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.589308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1805  DNA repair protein RecN, ABC transporter  24.73 
 
 		 559 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3362  hypothetical protein  55.26 
 
 		 665 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1466  ATPase  25.15 
 
 		 551 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0353535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0209  hypothetical protein  48.78 
 
 		 660 aa  42.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0547136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3325  hypothetical protein  28.88 
 
 		 630 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.275699  hitchhiker  2.24064e-21 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  53.33 
 
 		 533 aa  41.6  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>