131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0005 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0005  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  380  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.33307  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0007  hypothetical protein  94.87 
 
 
197 aa  318  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  hitchhiker  0.00984847 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  69.19 
 
 
195 aa  242  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  8.57448e-05  hitchhiker  9.41545e-07 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  51.3 
 
 
181 aa  181  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3288  hypothetical protein  52.63 
 
 
181 aa  173  2e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00723105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  51.04 
 
 
179 aa  172  3e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  52.88 
 
 
182 aa  169  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  39.2 
 
 
187 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  39.2 
 
 
187 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  38.46 
 
 
189 aa  113  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1654  membrane protein  37.37 
 
 
182 aa  112  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  37.37 
 
 
198 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.56412e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  39.46 
 
 
190 aa  110  2e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.04558e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  38.95 
 
 
188 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0168  hypothetical protein  37.43 
 
 
192 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  37.11 
 
 
186 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  34.27 
 
 
188 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.08383e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  36.27 
 
 
185 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  38.5 
 
 
188 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.11578e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  38.5 
 
 
188 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.61529e-05  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  38.5 
 
 
188 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.32525e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  38.5 
 
 
188 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  9.04735e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  38.5 
 
 
188 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.66044e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  38.5 
 
 
188 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  38.5 
 
 
188 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  38.5 
 
 
188 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  38.5 
 
 
188 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  34.18 
 
 
201 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  33.16 
 
 
181 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2300  protein of unknown function DUF204  35.26 
 
 
186 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.68239e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  36.65 
 
 
190 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0090  membrane protein  38.15 
 
 
184 aa  97.8  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0210402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  34.36 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  32.46 
 
 
185 aa  96.3  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  33.16 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  34.02 
 
 
190 aa  94  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  36.9 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  34.02 
 
 
190 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  36.9 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  36.9 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  36.9 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  36.9 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  33.51 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  35 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  33.16 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.0274e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  35.26 
 
 
190 aa  92  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  35.23 
 
 
190 aa  92  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.7692e-05  hitchhiker  2.75934e-05 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  34.21 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1800  cell division protein  34.74 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  33.71 
 
 
190 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  33.51 
 
 
189 aa  88.2  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  1.9593e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  31.75 
 
 
188 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  36.27 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  36.27 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0247  hypothetical protein  34.71 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21610  predicted membrane protein  35.57 
 
 
188 aa  87  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.890881  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1412  protein of unknown function DUF204  34.03 
 
 
189 aa  86.3  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000313106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  34.03 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4180  protein of unknown function DUF204  33.51 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.92866e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  36.92 
 
 
187 aa  85.9  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_952  hypothetical protein  33.68 
 
 
193 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  5.42228e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  36.32 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03700  predicted membrane protein  37.24 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0724834  normal  0.0195872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1232  protein of unknown function DUF204  34.54 
 
 
188 aa  85.1  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  32.98 
 
 
189 aa  84.3  1e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  8.80885e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  32.11 
 
 
189 aa  83.6  2e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1134  hypothetical protein  31.61 
 
 
193 aa  83.6  2e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  7.6644e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0963  hypothetical protein  31.09 
 
 
193 aa  81.3  8e-15  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  4.4765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  34.18 
 
 
193 aa  80.5  1e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  32.09 
 
 
232 aa  79.3  3e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  33.52 
 
 
178 aa  79  4e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  30.37 
 
 
189 aa  77.8  8e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  35.84 
 
 
196 aa  77  2e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3977  protein of unknown function DUF204  32.2 
 
 
191 aa  77  2e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.164698 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1107  protein of unknown function DUF204  30.89 
 
 
192 aa  76.3  3e-13  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4533  hypothetical protein  32.64 
 
 
188 aa  75.9  4e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0109117 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  31.98 
 
 
189 aa  75.5  5e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.18461e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  31.98 
 
 
189 aa  75.5  5e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  31.98 
 
 
189 aa  75.5  5e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  33.85 
 
 
184 aa  74.3  1e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  35.59 
 
 
200 aa  73.2  2e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4830  protein of unknown function DUF204  30.46 
 
 
195 aa  73.2  2e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0117076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3165  hypothetical protein  34.24 
 
 
180 aa  73.2  2e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  6.76254e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  31.79 
 
 
213 aa  73.2  3e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5008  integral membrane protein  28.65 
 
 
182 aa  73.2  3e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5505  hypothetical protein  28.27 
 
 
182 aa  72.4  4e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.9704e-06  unclonable  3.9395e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5451  hypothetical protein  28.12 
 
 
182 aa  72.4  4e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  31.28 
 
 
213 aa  72  6e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  28.25 
 
 
194 aa  70.9  1e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  8.7208e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5502  hypothetical protein  27.6 
 
 
182 aa  70.5  1e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.53104e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5024  integral membrane protein  27.6 
 
 
182 aa  70.1  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3318  protein of unknown function DUF204  28.79 
 
 
184 aa  69.3  3e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.861513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5122  hypothetical protein  28.8 
 
 
182 aa  69.3  3e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5447  hypothetical protein  28.27 
 
 
182 aa  69.7  3e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00491428  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1449  protein of unknown function DUF204  32.63 
 
 
189 aa  68.9  4e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.290539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5173  hypothetical protein  28.27 
 
 
182 aa  68.9  4e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5416  hypothetical protein  28.27 
 
 
182 aa  68.9  4e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5567  hypothetical protein  28.27 
 
 
182 aa  68.9  4e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000345667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1326  hypothetical protein  31.28 
 
 
185 aa  68.9  4e-11  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767112 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  29.79 
 
 
188 aa  68.6  5e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>