More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0001 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  96.26 
 
 
481 aa  973  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  3.10067e-05  unclonable  5.4574e-05 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  66.6 
 
 
470 aa  677  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.88551e-09  unclonable  4.72438e-10 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
481 aa  1006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  1.68448e-08  unclonable  2.04804e-06 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  44 
 
 
452 aa  399  1e-110  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  44 
 
 
452 aa  399  1e-110  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  41.3 
 
 
462 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  41.3 
 
 
462 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  41.34 
 
 
462 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.11976e-10  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  41.3 
 
 
460 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81375e-07  unclonable  6.00935e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  41.09 
 
 
460 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.24276e-06  unclonable  1.76e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  42.14 
 
 
462 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.81438e-07  unclonable  1.18337e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  41.3 
 
 
462 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  41.3 
 
 
462 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  41.93 
 
 
461 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.02323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  41.09 
 
 
460 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  40.67 
 
 
461 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.63579e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  41.09 
 
 
460 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  41.3 
 
 
459 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  7.81636e-06  unclonable  3.44978e-06 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  40.75 
 
 
472 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.51721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  41.09 
 
 
461 aa  392  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  41.93 
 
 
462 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  4.03403e-07  unclonable  1.36332e-10 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.96 
 
 
474 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.35 
 
 
455 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  41.21 
 
 
457 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.24276e-07  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  41.1 
 
 
478 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  40.98 
 
 
462 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  40.98 
 
 
462 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  42.46 
 
 
468 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.52796e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  40.5 
 
 
465 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  41.04 
 
 
463 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  40.45 
 
 
495 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  39.87 
 
 
467 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  41.32 
 
 
465 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.87 
 
 
467 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.36922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  39.87 
 
 
467 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.66 
 
 
464 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  39.87 
 
 
467 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  6.6194e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  41.95 
 
 
451 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  7.64641e-07  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  39.87 
 
 
467 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  5.58594e-06  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  39.87 
 
 
467 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  39.87 
 
 
467 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  41.18 
 
 
468 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  39.87 
 
 
467 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.89 
 
 
461 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  39.87 
 
 
467 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  40.55 
 
 
451 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  39.96 
 
 
455 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  40.2 
 
 
511 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.55 
 
 
451 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  1.23931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  40.25 
 
 
494 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.08 
 
 
462 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  41.13 
 
 
468 aa  375  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  40.25 
 
 
466 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.09 
 
 
442 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  41.7 
 
 
450 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  6.34969e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.46 
 
 
483 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.28329e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  39.68 
 
 
510 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  40.25 
 
 
466 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  40.25 
 
 
466 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  40.25 
 
 
466 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.44177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 
466 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  38.6 
 
 
524 aa  359  6e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0001  chromosomal replication initiation protein  50.89 
 
 
512 aa  358  1e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00010  chromosomal replication initiation protein  50.89 
 
 
514 aa  358  2e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373198  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.96 
 
 
467 aa  357  2e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  9.849e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  48.83 
 
 
533 aa  357  4e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  9.17685e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0001  chromosomal replication initiation protein  39.01 
 
 
487 aa  356  4e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  1.89853e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  50.89 
 
 
507 aa  356  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  50.89 
 
 
505 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0010  chromosomal replication initiation protein  50.89 
 
 
506 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  hitchhiker  3.64152e-05 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0001  chromosomal replication initiation protein  50.89 
 
 
511 aa  355  8e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.89 
 
 
511 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  39.28 
 
 
449 aa  355  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.62 
 
 
469 aa  355  1e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.79 
 
 
516 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  3.522e-07  unclonable  7.22922e-12 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  36.97 
 
 
452 aa  349  5e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  5.82235e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0001  chromosomal replication initiator protein, DnaA  38.35 
 
 
449 aa  346  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.02 
 
 
458 aa  343  3e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.53 
 
 
470 aa  343  5e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.33107e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.86 
 
 
476 aa  337  2e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00109258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.55 
 
 
452 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000132407  decreased coverage  0.000453889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3309  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.55 
 
 
452 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.59 
 
 
463 aa  322  1e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.46 
 
 
475 aa  319  5e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  34.16 
 
 
450 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  35.27 
 
 
465 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.0295e-06  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  35.61 
 
 
446 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03483  chromosomal replication initiation protein  35.03 
 
 
442 aa  316  6e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  36.23 
 
 
446 aa  314  2e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.4 
 
 
446 aa  314  2e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  35.4 
 
 
446 aa  314  2e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.88 
 
 
474 aa  314  3e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0537995  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  35.4 
 
 
446 aa  313  4e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  35.4 
 
 
446 aa  313  4e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  35.4 
 
 
446 aa  313  4e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  35.4 
 
 
446 aa  313  4e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  35.4 
 
 
446 aa  313  4e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.67 
 
 
446 aa  313  6e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 
446 aa  313  6e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.11 
 
 
457 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>