More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2383 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
348 aa  717    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2467  methionyl-tRNA formyltransferase  69.1 
 
 
363 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0926432 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  69.71 
 
 
361 aa  480  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  52.41 
 
 
318 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  51.08 
 
 
311 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  49.85 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  51.75 
 
 
310 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  49.54 
 
 
312 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  48.6 
 
 
318 aa  293  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  47.43 
 
 
318 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  49.37 
 
 
314 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  47.31 
 
 
315 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  49.85 
 
 
322 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  46.83 
 
 
318 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  50.63 
 
 
310 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  48.6 
 
 
329 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  50.63 
 
 
310 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  50.48 
 
 
314 aa  288  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  50.63 
 
 
310 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 
319 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  47.13 
 
 
318 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  50.8 
 
 
310 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  48.47 
 
 
316 aa  285  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 
314 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 
315 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  45.71 
 
 
315 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  47.52 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  48 
 
 
314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  47.83 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  47.35 
 
 
321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  47.2 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  46.5 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  47.24 
 
 
312 aa  282  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  48.62 
 
 
313 aa  281  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  47.2 
 
 
318 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  47.2 
 
 
318 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  47.2 
 
 
318 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  48.26 
 
 
317 aa  281  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  47.85 
 
 
315 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  46.99 
 
 
307 aa  279  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  47.4 
 
 
320 aa  279  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  47.2 
 
 
315 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  47.2 
 
 
315 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  47.2 
 
 
315 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  47.2 
 
 
315 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  48.73 
 
 
314 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  47.2 
 
 
315 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  47.2 
 
 
315 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 
315 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  47.55 
 
 
311 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  47.2 
 
 
315 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  47.2 
 
 
315 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  46.47 
 
 
344 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  46.69 
 
 
314 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  46.75 
 
 
331 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 
318 aa  275  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 
314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  47.08 
 
 
313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 
314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  45.65 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  45.4 
 
 
308 aa  273  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  44.98 
 
 
321 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  47.06 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  46.04 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  46.04 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  48.08 
 
 
323 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  46.04 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  48.08 
 
 
323 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  46.04 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  46.04 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  46.35 
 
 
314 aa  271  9e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  45 
 
 
327 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  45.79 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  49.26 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  47.3 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  48.81 
 
 
328 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  47.01 
 
 
315 aa  269  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  47.01 
 
 
315 aa  269  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  47.01 
 
 
315 aa  269  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  45.98 
 
 
337 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  45.98 
 
 
337 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  45.98 
 
 
337 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  45.48 
 
 
317 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  47.32 
 
 
327 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  46.9 
 
 
327 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  44.74 
 
 
308 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  46.9 
 
 
327 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 
318 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  46.9 
 
 
327 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  47.35 
 
 
357 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  46.61 
 
 
327 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  44.64 
 
 
323 aa  266  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  46.15 
 
 
315 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  48.81 
 
 
328 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  43.16 
 
 
315 aa  265  8e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 
327 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  47.32 
 
 
327 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  42.51 
 
 
318 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  47.32 
 
 
327 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>