More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2362 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  74.86 
 
 
556 aa  870    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
553 aa  1141    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  75.23 
 
 
556 aa  871    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  0.0000449891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10870  pyruvate or indole-3-pyruvate decarboxylase pdc  49.36 
 
 
560 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0234089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.14 
 
 
553 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  44.18 
 
 
555 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  42.46 
 
 
558 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  42.57 
 
 
561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  42.2 
 
 
561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.36 
 
 
552 aa  455  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  42.39 
 
 
558 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  41.74 
 
 
561 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000921209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  42.02 
 
 
561 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  42.02 
 
 
561 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  42.28 
 
 
558 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  42.58 
 
 
550 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  42.75 
 
 
550 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  42.93 
 
 
550 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  42.75 
 
 
550 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4795  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  44.4 
 
 
554 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.781269 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  39.56 
 
 
549 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.78 
 
 
546 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.78 
 
 
546 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.5 
 
 
561 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.217855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  36.46 
 
 
580 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.6 
 
 
572 aa  346  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.95 
 
 
547 aa  331  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  38.26 
 
 
568 aa  329  8e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  32.43 
 
 
542 aa  329  9e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0493266 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  34.12 
 
 
596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.49 
 
 
576 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86443  pyruvate decarboxylase  34.43 
 
 
570 aa  323  6e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.33 
 
 
558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.81 
 
 
552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.81 
 
 
552 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  33.22 
 
 
575 aa  300  4e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.39 
 
 
546 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.21 
 
 
550 aa  289  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  31.17 
 
 
713 aa  278  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2242  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.39 
 
 
558 aa  249  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.91 
 
 
557 aa  246  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.66 
 
 
562 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  31.72 
 
 
559 aa  244  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  31.53 
 
 
559 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62095  pyruvate decarboxylase (PDC6) (PDC3)  30.81 
 
 
623 aa  233  5e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.732507  normal  0.466164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  29.14 
 
 
547 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.87 
 
 
545 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  29.37 
 
 
549 aa  217  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.75 
 
 
551 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2896  indole-3-pyruvate decarboxylase (Indolepyruvatedecarboxylase)  39.23 
 
 
274 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal  0.207962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  27.02 
 
 
541 aa  203  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.178401 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3836  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.06 
 
 
586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  26.34 
 
 
543 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  26.61 
 
 
553 aa  167  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  26.51 
 
 
543 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  26.31 
 
 
543 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  26.54 
 
 
545 aa  156  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1754  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  26.59 
 
 
572 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  25.42 
 
 
542 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  24.47 
 
 
555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  24.49 
 
 
540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0027  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  24.91 
 
 
572 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173161 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.19 
 
 
584 aa  104  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.9 
 
 
561 aa  103  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03866  thiamine pyrophosphate-binding domain protein  24.43 
 
 
600 aa  103  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  26.49 
 
 
564 aa  103  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4081  thiamine pyrophosphate protein central region  25.09 
 
 
583 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721438  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6051  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.96 
 
 
393 aa  101  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221657  normal  0.609485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  23.41 
 
 
581 aa  97.8  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.19 
 
 
559 aa  97.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  22 
 
 
563 aa  97.1  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  21.41 
 
 
548 aa  97.1  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  21.98 
 
 
555 aa  94  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.21 
 
 
535 aa  94  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.24 
 
 
564 aa  92.8  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.46 
 
 
586 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.71 
 
 
556 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.71 
 
 
561 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0339  hypothetical protein  24.96 
 
 
576 aa  92.8  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  20.94 
 
 
550 aa  92  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  23.08 
 
 
547 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  23.87 
 
 
566 aa  91.3  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2521  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  22.14 
 
 
547 aa  91.3  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.948829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.42 
 
 
561 aa  90.1  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  22.88 
 
 
568 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  22.35 
 
 
547 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  22.35 
 
 
547 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  22.31 
 
 
547 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.59 
 
 
568 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.6 
 
 
572 aa  88.6  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.6 
 
 
572 aa  88.6  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  23.12 
 
 
552 aa  88.2  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  22.56 
 
 
546 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  22.56 
 
 
546 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.16 
 
 
562 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  22.56 
 
 
546 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  22.89 
 
 
547 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  21.97 
 
 
547 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  21.97 
 
 
547 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  21.93 
 
 
547 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>