More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2341 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  617  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  71.95 
 
 
298 aa  431  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  34.01 
 
 
294 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  34.31 
 
 
335 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  31.7 
 
 
302 aa  165  1e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  36.27 
 
 
298 aa  164  2e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 
310 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.19 
 
 
310 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  34.38 
 
 
302 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  33.67 
 
 
308 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  33.67 
 
 
308 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  34.4 
 
 
310 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  34.4 
 
 
310 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  34.16 
 
 
310 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  34.04 
 
 
310 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  34.04 
 
 
310 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  34.04 
 
 
310 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.77 
 
 
308 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  31.99 
 
 
310 aa  152  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  33.11 
 
 
310 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  31.68 
 
 
300 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  34.33 
 
 
324 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  31.21 
 
 
298 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  33.91 
 
 
322 aa  147  2e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  33.67 
 
 
308 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  33.67 
 
 
308 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  33.11 
 
 
310 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  34.01 
 
 
308 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  33.01 
 
 
308 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.13 
 
 
324 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  32.47 
 
 
308 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  31.88 
 
 
295 aa  141  2e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  30.56 
 
 
297 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  31.6 
 
 
312 aa  139  9e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 
312 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  30.9 
 
 
298 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  32.12 
 
 
301 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  30.31 
 
 
311 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  30.07 
 
 
291 aa  130  2e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 
290 aa  129  7e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  30.43 
 
 
303 aa  127  2e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  29.41 
 
 
295 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  28.52 
 
 
310 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  26.95 
 
 
294 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 
319 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  28.57 
 
 
302 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 
283 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  27.18 
 
 
302 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
324 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 
303 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  26.69 
 
 
301 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 
324 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  25.85 
 
 
311 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  27.62 
 
 
295 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  28.67 
 
 
291 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  27.82 
 
 
291 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  27.82 
 
 
317 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  28.72 
 
 
311 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  26.53 
 
 
296 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  29.86 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  27.24 
 
 
295 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  26.53 
 
 
319 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
299 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  26.28 
 
 
314 aa  95.5  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  26.97 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  26.41 
 
 
304 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  27.65 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  26.8 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  26.64 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
307 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1542  hypothetical protein  29.17 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  24.91 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  28.11 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  27.72 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  27.34 
 
 
290 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  24.51 
 
 
297 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.04 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  26.16 
 
 
305 aa  85.5  1e-15  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 
304 aa  85.1  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
301 aa  84.7  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  30.42 
 
 
319 aa  84.3  2e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  24.51 
 
 
310 aa  84  3e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  27.12 
 
 
304 aa  84.3  3e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
326 aa  82.4  1e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 
289 aa  81.3  2e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  24.56 
 
 
301 aa  80.5  3e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.41 
 
 
348 aa  79.7  5e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  24.52 
 
 
320 aa  79.7  6e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  25.68 
 
 
290 aa  79.3  8e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.33 
 
 
303 aa  77  4e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.31242e-05 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0581  hypothetical protein  27.08 
 
 
280 aa  76.6  5e-13  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 
301 aa  76.6  5e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 
305 aa  76.3  6e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 
305 aa  76.3  6e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  28.34 
 
 
297 aa  75.9  9e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  23.81 
 
 
301 aa  75.5  1e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  25.1 
 
 
299 aa  75.5  1e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 
312 aa  75.5  1e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  26.02 
 
 
303 aa  74.7  2e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>