More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2263 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 339 aa  685    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0089  hydroxymethylbilane synthase  70.72 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  70.47 
 
 		 345 aa  480  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  60.86 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  58.48 
 
 		 312 aa  381  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  59.45 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  60.25 
 
 		 326 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  59.2 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  58.1 
 
 		 313 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  58.15 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  60.75 
 
 		 326 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  59.33 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  59.38 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  59.75 
 
 		 310 aa  368  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  58.2 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  57.49 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  58.05 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 		 313 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  57.89 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  58.36 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  58.05 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  57.75 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  58.05 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  57.27 
 
 		 312 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  58.72 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  58.05 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 		 313 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  57.27 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  58.05 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  58.1 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  59.94 
 
 		 313 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  57.45 
 
 		 313 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  57.45 
 
 		 313 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  57.75 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  57.59 
 
 		 313 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  59.38 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  57.23 
 
 		 317 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  57.01 
 
 		 321 aa  361  8e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  56.23 
 
 		 313 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  57.28 
 
 		 322 aa  360  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  58.41 
 
 		 313 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  57.85 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  57.62 
 
 		 314 aa  355  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  57.54 
 
 		 309 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  56.36 
 
 		 313 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  56.36 
 
 		 313 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  55.96 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  57.32 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  57.32 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  57.32 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  57.01 
 
 		 311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  58.28 
 
 		 313 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  56.7 
 
 		 313 aa  352  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  57.32 
 
 		 310 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  58.26 
 
 		 310 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  56.75 
 
 		 317 aa  352  7e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  57.94 
 
 		 310 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  57.23 
 
 		 309 aa  351  8e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  58.1 
 
 		 313 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  57.94 
 
 		 310 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  57.94 
 
 		 310 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  57.8 
 
 		 313 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  57.63 
 
 		 310 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  56.19 
 
 		 315 aa  347  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  58.06 
 
 		 315 aa  345  7e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  56.71 
 
 		 316 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  53.69 
 
 		 319 aa  333  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  54.04 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  54.13 
 
 		 310 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  53.52 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  54.29 
 
 		 310 aa  328  6e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  51.24 
 
 		 311 aa  325  8.000000000000001e-88  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  52.92 
 
 		 310 aa  318  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  53.21 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  51.86 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  51.54 
 
 		 315 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  52.47 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  51.52 
 
 		 317 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0035  porphobilinogen deaminase  53.11 
 
 		 310 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  50.93 
 
 		 306 aa  293  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2166  porphobilinogen deaminase  51.81 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.600756 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  48.92 
 
 		 314 aa  293  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  49.69 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2571  porphobilinogen deaminase  51.96 
 
 		 338 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2179  porphobilinogen deaminase  51.57 
 
 		 327 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230446  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  50.89 
 
 		 320 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  50.89 
 
 		 320 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0656  porphobilinogen deaminase  48.34 
 
 		 325 aa  285  9e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  48.79 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1200  porphobilinogen deaminase  49.09 
 
 		 321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.580193  normal  0.533215 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  51.08 
 
 		 304 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0869  porphobilinogen deaminase  52.55 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326995  normal  0.554351 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  48.79 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  49.1 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5752  porphobilinogen deaminase  52.87 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  49.11 
 
 		 322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2690  porphobilinogen deaminase  49.24 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>