264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2211 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
317 aa  661  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  89.39 
 
 
329 aa  592  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  88.96 
 
 
350 aa  585  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.05 
 
 
315 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.05 
 
 
315 aa  547  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.39 
 
 
315 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  3.78016e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.72 
 
 
315 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  8.95825e-12 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.39 
 
 
315 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.72 
 
 
315 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  1.12208e-10 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  82.72 
 
 
315 aa  538  1e-152  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.05 
 
 
318 aa  540  1e-152  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  82.39 
 
 
335 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  82.06 
 
 
315 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  81.85 
 
 
317 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.93 
 
 
364 aa  504  1e-142  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.82 
 
 
301 aa  494  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.11 
 
 
301 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.93 
 
 
306 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.11 
 
 
301 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
301 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.11 
 
 
301 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.39617e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
301 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.87933e-08 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
301 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  7.85129e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
301 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.16 
 
 
301 aa  490  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.11 
 
 
301 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
301 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.11 
 
 
301 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.77 
 
 
301 aa  484  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  75.17 
 
 
314 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.08 
 
 
301 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.82 
 
 
318 aa  478  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.74 
 
 
301 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2115  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.72 
 
 
319 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.160845  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.72 
 
 
319 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.69 
 
 
309 aa  480  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.5 
 
 
314 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.48 
 
 
323 aa  480  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0005  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.83 
 
 
311 aa  474  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.62 
 
 
287 aa  474  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  75.68 
 
 
308 aa  475  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4168  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.59 
 
 
304 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.52 
 
 
302 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03411  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.25 
 
 
303 aa  469  1e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.27 
 
 
287 aa  469  1e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3762  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.25 
 
 
303 aa  469  1e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.34 
 
 
308 aa  468  1e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3978  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.92 
 
 
303 aa  467  1e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.805  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4055  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.25 
 
 
303 aa  469  1e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.49 
 
 
317 aa  468  1e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0042  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.68 
 
 
304 aa  469  1e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03362  hypothetical protein  75.25 
 
 
303 aa  469  1e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3869  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.92 
 
 
303 aa  467  1e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.09 
 
 
317 aa  467  1e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.09 
 
 
317 aa  467  1e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.34 
 
 
303 aa  468  1e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.33 
 
 
312 aa  468  1e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3932  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.92 
 
 
303 aa  467  1e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3850  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.92 
 
 
303 aa  468  1e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0155  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.25 
 
 
303 aa  469  1e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0151  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  75.25 
 
 
303 aa  469  1e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.25 
 
 
303 aa  469  1e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.943552  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3965  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.25 
 
 
303 aa  469  1e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4935  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.25 
 
 
303 aa  469  1e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4038  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.92 
 
 
303 aa  467  1e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.03 
 
 
309 aa  470  1e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0069  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.83 
 
 
304 aa  466  1e-130  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.055597  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.09 
 
 
327 aa  465  1e-130  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3983  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.85 
 
 
303 aa  467  1e-130  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75 
 
 
304 aa  466  1e-130  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03831  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.55 
 
 
302 aa  461  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1805  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.7 
 
 
301 aa  461  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0022  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.06 
 
 
304 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.535702  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.39 
 
 
304 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0888  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.78 
 
 
307 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3783  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.06 
 
 
304 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.73 
 
 
308 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1804  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.7 
 
 
301 aa  461  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.78 
 
 
307 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0761934  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4131  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.06 
 
 
304 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.47 
 
 
308 aa  460  1e-128  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.22 
 
 
287 aa  459  1e-128  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.78552e-07 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.19 
 
 
301 aa  460  1e-128  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1232  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.52 
 
 
303 aa  460  1e-128  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2348  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.45 
 
 
312 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.77 
 
 
301 aa  454  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.7 
 
 
312 aa  454  1e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.16 
 
 
314 aa  452  1e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.43 
 
 
325 aa  452  1e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0551  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.76 
 
 
301 aa  448  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2498  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.73 
 
 
330 aa  448  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2580  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.14 
 
 
294 aa  444  1e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.75 
 
 
318 aa  446  1e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2351  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.47 
 
 
392 aa  445  1e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6028  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.47 
 
 
334 aa  445  1e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.042164  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2209  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.14 
 
 
294 aa  444  1e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2753  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.47 
 
 
334 aa  445  1e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.467526  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2728  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.47 
 
 
334 aa  445  1e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.47 
 
 
390 aa  445  1e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0216  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.82 
 
 
317 aa  445  1e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0389393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>