297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2157 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  45.81 
 
 		 176 aa  169  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  43.58 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  34.09 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  38.36 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  42.67 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  42 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  40.52 
 
 		 184 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  38.71 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  41.33 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  37.58 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  37.58 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  35.03 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  34.62 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  32.32 
 
 		 178 aa  91.3  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  33.91 
 
 		 181 aa  91.3  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  31.43 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  35.06 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  28.38 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  28.38 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  33.75 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  30.57 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  27.61 
 
 		 515 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  28.12 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  29.6 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  26.97 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  29.93 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  31.29 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  33.02 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  30.77 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  35.71 
 
 		 568 aa  58.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  31.96 
 
 		 533 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  33.33 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  30.4 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  27.78 
 
 		 528 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  27.97 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  33.93 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  31.91 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  27.43 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  28.32 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  29.41 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  28.97 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  31.06 
 
 		 479 aa  54.7  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  28.97 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  30.6 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  26.32 
 
 		 466 aa  53.9  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  31.18 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  29.29 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  29.71 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  29.82 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  26.21 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  28.46 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  25 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  25.97 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  28.28 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  26.77 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  33.65 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  28.16 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  27.47 
 
 		 478 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  29.63 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  27.27 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  26.21 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  33.68 
 
 		 326 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  33.68 
 
 		 326 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  33.68 
 
 		 326 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  33.68 
 
 		 326 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  25.95 
 
 		 531 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  34.29 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  31.18 
 
 		 518 aa  51.2  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.36 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  27.17 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  31.73 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  26.28 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.78 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  29.66 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  23.75 
 
 		 316 aa  50.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2215  CheW-like protein  32.94 
 
 		 492 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0691  putative CheW protein  28.95 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  27.69 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  28.32 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  24.8 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  28.71 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  24.8 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  30.85 
 
 		 301 aa  49.7  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0932  putative CheW protein  28.57 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.432309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  28.3 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  24.73 
 
 		 365 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2442  CheW domain protein  33.72 
 
 		 487 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  27.69 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  27.69 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  27.45 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  25.81 
 
 		 365 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  32.26 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  32.26 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  25.88 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  29.49 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  27.96 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  29.03 
 
 		 155 aa  48.5  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  25 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>