More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2137 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2137  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194801  hitchhiker  0.00234339 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2099  translation initiation factor 3  86.83 
 
 		 167 aa  281  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000973621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2418  translation initiation factor IF-3  86.83 
 
 		 167 aa  281  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000103709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  58.18 
 
 		 183 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  58.18 
 
 		 183 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  58.18 
 
 		 183 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  58.18 
 
 		 177 aa  206  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  56.97 
 
 		 178 aa  196  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  56.97 
 
 		 178 aa  196  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  58.18 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  56.71 
 
 		 173 aa  194  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  57.67 
 
 		 182 aa  194  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  57.58 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  56.97 
 
 		 177 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  55.76 
 
 		 177 aa  190  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2379  translation initiation factor IF-3  55.15 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0845211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  55.15 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000118732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  55.15 
 
 		 177 aa  187  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  56.77 
 
 		 155 aa  187  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 166 aa  184  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  54.84 
 
 		 184 aa  181  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 173 aa  181  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  55.28 
 
 		 190 aa  180  9.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  52.15 
 
 		 180 aa  177  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2596  translation initiation factor IF-3  56.36 
 
 		 177 aa  176  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000880416  hitchhiker  0.000575086 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1009  translation initiation factor IF-3  55.49 
 
 		 169 aa  176  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  54.6 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  54.6 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  54.6 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  54.72 
 
 		 185 aa  175  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  61.94 
 
 		 137 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  53.05 
 
 		 163 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  50.93 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  51.55 
 
 		 197 aa  175  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 227 aa  174  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  54.55 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  54.22 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 		 194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  50.3 
 
 		 225 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 		 195 aa  171  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 		 195 aa  171  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 		 195 aa  171  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 		 195 aa  171  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 219 aa  171  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  52.56 
 
 		 156 aa  171  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 		 186 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 175 aa  170  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 169 aa  169  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  53.01 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  53.69 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  48.45 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 205 aa  168  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 250 aa  168  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  51.59 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 199 aa  168  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  51.85 
 
 		 182 aa  168  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  51.28 
 
 		 156 aa  168  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 180 aa  168  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 239 aa  168  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  49.7 
 
 		 243 aa  168  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>