More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2122 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  49.06 
 
 		 774 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2410  RNA binding S1 domain protein  45.44 
 
 		 795 aa  657    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367587  normal  0.911918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  46.61 
 
 		 772 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  46.92 
 
 		 773 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.31 
 
 		 798 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.01 
 
 		 774 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.19 
 
 		 861 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.34 
 
 		 787 aa  666    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.29 
 
 		 784 aa  667    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2122  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 849 aa  1730    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161735  normal  0.0955174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1032  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.01 
 
 		 735 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.013008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  48.93 
 
 		 779 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.46 
 
 		 774 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4965  putative transcription accessory protein  44.93 
 
 		 796 aa  662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.32 
 
 		 774 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  45.68 
 
 		 767 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4629  hypothetical protein  45.14 
 
 		 784 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  48.53 
 
 		 773 aa  666    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1368  transcription-related protein  44.2 
 
 		 772 aa  660    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.73 
 
 		 776 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.66 
 
 		 773 aa  643    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3804  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.9 
 
 		 813 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  49.06 
 
 		 774 aa  658    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2891  hypothetical protein  47.53 
 
 		 789 aa  645    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2746  hypothetical protein  47.4 
 
 		 789 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2166  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.62 
 
 		 780 aa  642    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.897398  normal  0.40683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  48.36 
 
 		 772 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  49.06 
 
 		 774 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0127  hypothetical protein  72.54 
 
 		 840 aa  1227    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.294313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  46.53 
 
 		 772 aa  666    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  46.99 
 
 		 777 aa  672    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  48.87 
 
 		 802 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1945  hypothetical protein  46.59 
 
 		 800 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10863  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  46.66 
 
 		 791 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  49.06 
 
 		 821 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  47.81 
 
 		 765 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  48.79 
 
 		 774 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  49.06 
 
 		 774 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  48.35 
 
 		 782 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.76 
 
 		 777 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  48.26 
 
 		 774 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  46.75 
 
 		 773 aa  638    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.76 
 
 		 787 aa  676    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.8 
 
 		 774 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3444  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.16 
 
 		 787 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1585  RNA binding S1  47.68 
 
 		 790 aa  663    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  48.27 
 
 		 775 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2991  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.97 
 
 		 772 aa  646    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.940851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  46.79 
 
 		 773 aa  645    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.13 
 
 		 812 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  49.06 
 
 		 774 aa  658    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  48.41 
 
 		 772 aa  689    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  44.53 
 
 		 782 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0587  RNA binding S1 domain protein  45.44 
 
 		 777 aa  638    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173141  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 		 781 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  46.16 
 
 		 799 aa  658    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2039  RNA binding S1 domain protein  47.57 
 
 		 795 aa  693    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.883528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2655  RNA binding S1  47.14 
 
 		 804 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.047572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0136  RNA binding S1  72.07 
 
 		 840 aa  1226    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  48.38 
 
 		 787 aa  696    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  45.21 
 
 		 814 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  48.09 
 
 		 815 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0153  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.83 
 
 		 802 aa  678    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  46.12 
 
 		 775 aa  687    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  45.1 
 
 		 772 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  47.88 
 
 		 778 aa  688    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.89 
 
 		 804 aa  666    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  46.79 
 
 		 773 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  48.91 
 
 		 767 aa  671    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3809  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.81 
 
 		 779 aa  656    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3885  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.05 
 
 		 779 aa  654    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1472  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.36 
 
 		 782 aa  688    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.51 
 
 		 790 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.13 
 
 		 774 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2945  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.63 
 
 		 776 aa  666    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  47.81 
 
 		 779 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  46.89 
 
 		 773 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  47.94 
 
 		 779 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.5 
 
 		 787 aa  675    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1822  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.96 
 
 		 815 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.569031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  46.53 
 
 		 773 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.59 
 
 		 780 aa  669    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.52 
 
 		 774 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.32 
 
 		 787 aa  674    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  47.53 
 
 		 788 aa  697    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.16 
 
 		 803 aa  661    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4013  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.69 
 
 		 779 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  47.31 
 
 		 766 aa  669    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  46.53 
 
 		 791 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  46.48 
 
 		 778 aa  666    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1303  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.71 
 
 		 772 aa  669    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.035241  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  48.52 
 
 		 777 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.32 
 
 		 813 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.01 
 
 		 774 aa  680    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  46.79 
 
 		 773 aa  645    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0170  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.66 
 
 		 791 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0539  RNA binding S1 domain protein  45.42 
 
 		 769 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.500263  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  46.92 
 
 		 773 aa  645    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  49.06 
 
 		 774 aa  658    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00795  S1 RNA binding domain protein  47.1 
 
 		 786 aa  660    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0660252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>