182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2055 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  44.31 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  42.5 
 
 
172 aa  138  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  39.47 
 
 
161 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  36.53 
 
 
181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  39.75 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  37.87 
 
 
175 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  39.13 
 
 
165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  36.75 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  35.93 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  37.16 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  35.93 
 
 
175 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  37.87 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  36.65 
 
 
175 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  36.65 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  37.27 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  37.27 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  37.27 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  36.65 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  36.65 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  36.65 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  36.65 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  37.58 
 
 
175 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  37.82 
 
 
169 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  37.82 
 
 
169 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  36.65 
 
 
178 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  37.82 
 
 
169 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  36.02 
 
 
175 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  41.55 
 
 
171 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  35.54 
 
 
175 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  34.38 
 
 
176 aa  105  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  37.89 
 
 
161 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  36.02 
 
 
163 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  33.12 
 
 
165 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  33.12 
 
 
165 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  37.93 
 
 
167 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  33.12 
 
 
165 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  37.93 
 
 
167 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  33.12 
 
 
165 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  33.12 
 
 
165 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  33.12 
 
 
165 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  37.93 
 
 
167 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  33.12 
 
 
165 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  33.12 
 
 
165 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  33.33 
 
 
165 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  33.33 
 
 
165 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  33.33 
 
 
165 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  33.12 
 
 
165 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  34.78 
 
 
175 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  41.22 
 
 
162 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  36.53 
 
 
168 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  33.33 
 
 
165 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  33.33 
 
 
165 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  36.53 
 
 
168 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  35.44 
 
 
164 aa  101  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  35.4 
 
 
163 aa  101  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  32.92 
 
 
165 aa  100  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  32.32 
 
 
167 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  33.54 
 
 
170 aa  100  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  34.78 
 
 
171 aa  99  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  31.71 
 
 
167 aa  99  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  32.3 
 
 
175 aa  98.2  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  34.57 
 
 
170 aa  98.2  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  33.33 
 
 
166 aa  97.4  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  34.57 
 
 
170 aa  97.4  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  35 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  36.31 
 
 
477 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  35.37 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  33.54 
 
 
175 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  36.02 
 
 
173 aa  94.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  35.98 
 
 
163 aa  94.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  38.93 
 
 
166 aa  94.7  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  32.93 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  35.37 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  32.93 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  32.32 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  34.57 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  37.84 
 
 
163 aa  92.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  39.49 
 
 
175 aa  92  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  32.3 
 
 
174 aa  91.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000415587  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  37.04 
 
 
172 aa  91.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  31.93 
 
 
165 aa  91.3  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  37.04 
 
 
172 aa  90.9  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  38.46 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  38.56 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  38.56 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  38.56 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  40.46 
 
 
162 aa  90.1  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  31.43 
 
 
162 aa  89.4  3e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  30.3 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  37.91 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  37.91 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  37.91 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  37.91 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  37.91 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  37.91 
 
 
168 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  32.3 
 
 
164 aa  87.4  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6539  Ferritin Dps family protein  35.61 
 
 
176 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  32.92 
 
 
169 aa  87  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  37.25 
 
 
168 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>