16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1996 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1996  hypothetical protein  100 
 
 
583 aa  1187    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2870  hypothetical protein  31.12 
 
 
554 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0416  hypothetical protein  34.91 
 
 
559 aa  110  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0143  hypothetical protein  34.57 
 
 
571 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0838  conserved hypothetical protein, KAP family  31.53 
 
 
607 aa  90.9  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334041  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1427  hypothetical protein  30.05 
 
 
449 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4279  KAP P-loop domain protein  25.96 
 
 
528 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3630  KAP P-loop domain-containing protein  28.57 
 
 
608 aa  67  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2406  KAP P-loop domain protein, putative  29.19 
 
 
665 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109469  normal  0.0676098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5228  KAP P-loop domain protein  24.54 
 
 
210 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417016 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0781  KAP P-loop domain-containing protein  27.34 
 
 
606 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1510  KAP P-loop domain protein  28.98 
 
 
643 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.706242  decreased coverage  3.38847e-17 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5554  hypothetical protein  47.27 
 
 
64 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.79575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1493  hypothetical protein  28.81 
 
 
624 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000440565  decreased coverage  0.000142627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4211  KAP P-loop  24.29 
 
 
741 aa  47.4  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.820288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0052  hypothetical protein  24.79 
 
 
588 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>