More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1991 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 296 aa  614  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1682  TatD family Mg-dependent DNase  56.6 
 
 		 335 aa  345  4e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.415868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1953  TatD-related deoxyribonuclease  55.84 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.884488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  36.46 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  36.3 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  39.15 
 
 		 256 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  34.88 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  35.59 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  35.23 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  35.66 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  36.2 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  35.94 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  35.11 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  38.2 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  36.82 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  36.82 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  38.52 
 
 		 283 aa  146  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  33.45 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  33.45 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  35.11 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  33.45 
 
 		 254 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  36.04 
 
 		 260 aa  142  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  33.45 
 
 		 254 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  37.19 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  36.04 
 
 		 260 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  34.64 
 
 		 258 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  31.74 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  34.27 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  34.64 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  34.41 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  36.04 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  36.04 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  31.32 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  36.46 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  36.04 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  32.74 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  34.97 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  35.69 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  39.45 
 
 		 225 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  36.1 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  35.82 
 
 		 256 aa  136  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  33.21 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  32.07 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  34.97 
 
 		 257 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  34.97 
 
 		 257 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  34.97 
 
 		 257 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  32.97 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  34.97 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  33.45 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  36.14 
 
 		 257 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  32.89 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  34.24 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  31.03 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  37.32 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  37.32 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  34.01 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  33.58 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  31.67 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  32.03 
 
 		 268 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  33.45 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  32.84 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  30.96 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  30.96 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  30.85 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  33.45 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  30.04 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  33.69 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  30.25 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  34.07 
 
 		 262 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  38.86 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  30.6 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  34.69 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  30.39 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  33.68 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  34.69 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  31.38 
 
 		 262 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  33.58 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  34.32 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  31.82 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  34.43 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  33.9 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  30.04 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  36.82 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  35.38 
 
 		 278 aa  123  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  32.76 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  32 
 
 		 256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  31.73 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  31.54 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  32.46 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  31.43 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  38.63 
 
 		 257 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  34.47 
 
 		 282 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  33.92 
 
 		 255 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  33.45 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1042  TatD-related deoxyribonuclease  36.65 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  33.05 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  30.2 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  30.1 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  34.07 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>