More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1950 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  80.09 
 
 		 648 aa  1076    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  100 
 
 		 653 aa  1331    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  81.19 
 
 		 648 aa  1076    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  48.78 
 
 		 642 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  49.55 
 
 		 649 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  49.33 
 
 		 649 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  49.01 
 
 		 642 aa  591  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  49.02 
 
 		 641 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  49.33 
 
 		 661 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  49.33 
 
 		 661 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  49.32 
 
 		 645 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  50.38 
 
 		 631 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  47.74 
 
 		 640 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  47.04 
 
 		 639 aa  578  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  48.48 
 
 		 643 aa  578  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  48.13 
 
 		 649 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  47.05 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  47.59 
 
 		 640 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  48.13 
 
 		 649 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  49.7 
 
 		 623 aa  580  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  47.67 
 
 		 641 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  47.48 
 
 		 639 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  46.2 
 
 		 637 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  47.26 
 
 		 638 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  46.2 
 
 		 637 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  46.2 
 
 		 637 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  46.47 
 
 		 641 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  47.44 
 
 		 640 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  49.17 
 
 		 648 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  46.32 
 
 		 641 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  46.47 
 
 		 641 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  48.78 
 
 		 641 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  46.47 
 
 		 641 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  50.45 
 
 		 663 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  48.87 
 
 		 688 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  50.15 
 
 		 636 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  47.35 
 
 		 639 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  49.47 
 
 		 633 aa  572  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  46.82 
 
 		 626 aa  571  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 660 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 648 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 648 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 660 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 660 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 1065 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  48.09 
 
 		 640 aa  566  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 648 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  46.94 
 
 		 594 aa  565  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 648 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  47.71 
 
 		 639 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  46.84 
 
 		 640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000565711  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 		 636 aa  559  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  46.97 
 
 		 638 aa  559  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  45.19 
 
 		 647 aa  561  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0384  ABC transporter related  47.79 
 
 		 628 aa  559  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  46.81 
 
 		 638 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  48.67 
 
 		 615 aa  557  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 632 aa  556  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  48.39 
 
 		 627 aa  558  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  47.34 
 
 		 641 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  45.95 
 
 		 635 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  46.28 
 
 		 646 aa  557  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 637 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  45.78 
 
 		 649 aa  549  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  46.96 
 
 		 636 aa  550  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  44.7 
 
 		 648 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  46.46 
 
 		 645 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0171  ABC transporter-related protein  46.92 
 
 		 639 aa  550  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  47.57 
 
 		 639 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  47.49 
 
 		 645 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  48.04 
 
 		 646 aa  548  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  48.43 
 
 		 650 aa  547  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  47.57 
 
 		 638 aa  543  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  45.5 
 
 		 635 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  46.04 
 
 		 629 aa  545  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 637 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  45.36 
 
 		 645 aa  541  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  46.13 
 
 		 634 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  45.34 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  44.48 
 
 		 640 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  47.78 
 
 		 639 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  46.36 
 
 		 648 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  47.18 
 
 		 641 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3061  ABC transporter related  48.27 
 
 		 663 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0828579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  48.62 
 
 		 636 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  47.32 
 
 		 623 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  45.19 
 
 		 637 aa  537  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 		 636 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  45.34 
 
 		 629 aa  535  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  43.5 
 
 		 641 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 642 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  45.41 
 
 		 635 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  45.19 
 
 		 635 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  45.41 
 
 		 635 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  45.41 
 
 		 635 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  46.69 
 
 		 642 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  45.41 
 
 		 635 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  45.41 
 
 		 635 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  46.27 
 
 		 642 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  46.54 
 
 		 642 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>