More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1938 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0265  IS1 transposase  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.878281 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0700  IS1 transposase  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1525  IS1 transposase  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1938  IS1 transposase  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1444  putative transposase  57.14 
 
 
108 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  31.53 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0270  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0855  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0978  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1570  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54283  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1612  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1816  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.495778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2200  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209306  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2454  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875494  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2714  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2883  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00013028  normal  0.0546907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3632  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00026173  normal  0.763989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3881  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.719771  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3893  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3346  insertion element protein  31.25 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3171  insertion element protein  31.7 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.22651  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3185  insertion element protein  31.7 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  30.36 
 
 
232 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5203  Insertion element protein  29.96 
 
 
230 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32414e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1208  Insertion element protein  29.96 
 
 
230 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2516  Insertion element protein  29.96 
 
 
230 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5744  Insertion element protein  29.96 
 
 
230 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1409  IS1 transposase orfB  37.5 
 
 
164 aa  88.2  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3961  IS1 transposase orfB  37.98 
 
 
167 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1282  hypothetical protein  29.77 
 
 
232 aa  87  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.147324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3246  IS1 transposase orfB  37.98 
 
 
167 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.25773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3362  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3916  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.753091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2054  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4359  IS1 transposase orfB  36.5 
 
 
167 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2611  IS1 transposase orfB  36.5 
 
 
167 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2010  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3813  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4550  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3140  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3209  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2048  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.72141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1319  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.808236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0546  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0288  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.907717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4512  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3746  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1626  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2071  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4803  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4540  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1733  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1729  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2814  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3236  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4874  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0909  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00244451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4689  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1484  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0997  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1696  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3051  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3597  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.169674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3942  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2649  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0560  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00131966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1499  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0964  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1621  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
220 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1712  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.674197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1705  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.426692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1629  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1518  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.700974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1981  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3270  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2060  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2090  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3228  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0009  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2683  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.393271  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1722  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2727  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.5  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3013  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2878  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.366838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1964  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.508831  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1065  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1513  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000394756  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1578  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0917  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00131212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1082  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0975  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00027943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1332  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00400739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2991  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.5  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028638  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1572  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1671  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.5  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0130  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000385847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0214  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.672743  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0221  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0260  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0270  IS1 transposase orfB  37.21 
 
 
167 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>