More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1923 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
369 aa  768  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  7.22148e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  73.57 
 
 
371 aa  556  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  54.52 
 
 
355 aa  355  6e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  49.29 
 
 
371 aa  342  4e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  52.09 
 
 
363 aa  340  3e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  51.45 
 
 
380 aa  338  1e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  51.41 
 
 
354 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  51.56 
 
 
381 aa  335  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  52.54 
 
 
359 aa  333  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  51.32 
 
 
360 aa  331  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  50.29 
 
 
372 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  52.91 
 
 
378 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  52.92 
 
 
359 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  47.55 
 
 
378 aa  329  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  47.55 
 
 
378 aa  329  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  3.1101e-06 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  50 
 
 
385 aa  328  8e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  49.86 
 
 
365 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  53.33 
 
 
378 aa  324  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  49.72 
 
 
396 aa  321  1e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  49.04 
 
 
360 aa  321  2e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  47.51 
 
 
359 aa  320  2e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  47.66 
 
 
374 aa  319  4e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  50.74 
 
 
375 aa  317  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  49.26 
 
 
356 aa  315  5e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  50.73 
 
 
373 aa  314  1e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  50.71 
 
 
363 aa  313  2e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  49.29 
 
 
368 aa  308  8e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  46.94 
 
 
359 aa  308  8e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  51.33 
 
 
376 aa  308  1e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  48.47 
 
 
357 aa  305  1e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  52.03 
 
 
373 aa  303  3e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  47.06 
 
 
358 aa  303  4e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  45.32 
 
 
364 aa  299  4e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  48.1 
 
 
353 aa  298  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  50.88 
 
 
356 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  45.64 
 
 
356 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  51.66 
 
 
359 aa  289  7e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  43.23 
 
 
367 aa  287  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  46.5 
 
 
369 aa  286  6e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  45.38 
 
 
364 aa  285  8e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  45 
 
 
356 aa  284  2e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  45 
 
 
356 aa  284  2e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  50 
 
 
359 aa  281  9e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  45.48 
 
 
364 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  41.33 
 
 
425 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  46.35 
 
 
349 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  45.11 
 
 
364 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  46.07 
 
 
349 aa  273  4e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  44.41 
 
 
360 aa  273  5e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1586  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  44.06 
 
 
361 aa  272  5e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  47.35 
 
 
359 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  44.21 
 
 
369 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  47.35 
 
 
359 aa  270  3e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  43.1 
 
 
353 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 
426 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0460  DNA polymerase IV  46.69 
 
 
356 aa  269  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  43.63 
 
 
392 aa  269  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  47.35 
 
 
359 aa  269  6e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  43.19 
 
 
352 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  44.97 
 
 
357 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  44.06 
 
 
389 aa  266  3e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  41.97 
 
 
350 aa  266  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 
393 aa  266  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  44.31 
 
 
361 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  44.31 
 
 
383 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  44.31 
 
 
408 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  42.11 
 
 
466 aa  266  6e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  43.14 
 
 
357 aa  265  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  41.29 
 
 
399 aa  265  9e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  42.94 
 
 
352 aa  265  9e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  44.44 
 
 
357 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  45.01 
 
 
358 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  41.62 
 
 
418 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  47.93 
 
 
353 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  43.9 
 
 
362 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  42.78 
 
 
354 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1185  DNA polymerase IV  46.36 
 
 
358 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.35845e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1876  DNA polymerase IV  45.75 
 
 
360 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  46.15 
 
 
359 aa  262  5e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  44.18 
 
 
355 aa  262  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  41.76 
 
 
399 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  44.38 
 
 
357 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  42.32 
 
 
352 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  42.13 
 
 
418 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  44.25 
 
 
348 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  43.44 
 
 
405 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  43.14 
 
 
379 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002716  DNA polymerase IV  46.38 
 
 
356 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  41.85 
 
 
418 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  42.69 
 
 
355 aa  259  5e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  40.97 
 
 
384 aa  259  7e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  43.4 
 
 
353 aa  259  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  43.73 
 
 
429 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  45.36 
 
 
358 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  42.09 
 
 
355 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  42.86 
 
 
379 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  43.15 
 
 
407 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  45.36 
 
 
358 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  41.62 
 
 
354 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  45.7 
 
 
358 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>