More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1877 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
404 aa  830    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  70.23 
 
 
416 aa  581  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  69.31 
 
 
412 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  52.03 
 
 
404 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  52.04 
 
 
397 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  51.03 
 
 
411 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  51.67 
 
 
419 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  52.3 
 
 
397 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  52.19 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  51.16 
 
 
397 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  50.9 
 
 
404 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  50.9 
 
 
416 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  50.5 
 
 
428 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  50.52 
 
 
586 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  50.52 
 
 
405 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  50.13 
 
 
406 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  49 
 
 
406 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  50.52 
 
 
405 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  50.52 
 
 
405 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  50.13 
 
 
406 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  50.52 
 
 
389 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  50.52 
 
 
405 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  48.84 
 
 
398 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  50.39 
 
 
406 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  50.52 
 
 
389 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  50.39 
 
 
406 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  50.52 
 
 
405 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  49.87 
 
 
406 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  49.61 
 
 
406 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  47.67 
 
 
403 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  43.3 
 
 
384 aa  343  2e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  43.81 
 
 
384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  46.02 
 
 
388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  47.03 
 
 
388 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  46.53 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  47.03 
 
 
386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  42.97 
 
 
388 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  45.64 
 
 
392 aa  335  7.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  46.23 
 
 
390 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  46.19 
 
 
382 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  46.41 
 
 
386 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  45.5 
 
 
387 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  46.7 
 
 
387 aa  332  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  46.41 
 
 
386 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  45.97 
 
 
387 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  46.67 
 
 
400 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  46.15 
 
 
391 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  46.41 
 
 
386 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  44.59 
 
 
386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  43.04 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  44.94 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  45.74 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  46.13 
 
 
389 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  45.7 
 
 
384 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43.15 
 
 
402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  45.7 
 
 
384 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  45.68 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  42.17 
 
 
389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  40.36 
 
 
385 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  41.05 
 
 
406 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  39.59 
 
 
385 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.46 
 
 
391 aa  290  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.72 
 
 
391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.47 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  41.64 
 
 
410 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  41.65 
 
 
424 aa  282  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  41.41 
 
 
388 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  39.29 
 
 
385 aa  279  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  41.62 
 
 
383 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  41.56 
 
 
387 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  41.45 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  38.82 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  37.8 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  40.21 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  37.87 
 
 
389 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  39.43 
 
 
389 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  37.66 
 
 
397 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  38.7 
 
 
380 aa  259  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  39.71 
 
 
376 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  37.11 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  35.94 
 
 
379 aa  249  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  36.88 
 
 
374 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  36.84 
 
 
374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  37.27 
 
 
374 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  37.24 
 
 
373 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  36.72 
 
 
375 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2582  acetylornithine deacetylase (ArgE)  39.24 
 
 
397 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  35.73 
 
 
391 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  34.68 
 
 
383 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  34.97 
 
 
381 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  34.05 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  34.48 
 
 
383 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.67 
 
 
389 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  33.16 
 
 
387 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  34.5 
 
 
382 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  33.62 
 
 
386 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  34.27 
 
 
381 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  32.25 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  32.53 
 
 
386 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>