More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1845 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
341 aa  696    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  63.24 
 
 
339 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  63.53 
 
 
339 aa  434  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  46.22 
 
 
328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  41.9 
 
 
370 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  40.65 
 
 
331 aa  238  9e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  39.58 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  39.58 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  39.29 
 
 
330 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  36.14 
 
 
333 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  35.83 
 
 
333 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  35.44 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  35.19 
 
 
328 aa  192  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  32.61 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  33.73 
 
 
336 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  33.85 
 
 
348 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  31.74 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  31.74 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  33.63 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  33.23 
 
 
407 aa  169  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  29.91 
 
 
331 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  30.84 
 
 
330 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  33.84 
 
 
337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  30.68 
 
 
333 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  32.93 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  31.78 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  31.89 
 
 
330 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  32.09 
 
 
335 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  32.12 
 
 
333 aa  156  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  30.09 
 
 
332 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  32.05 
 
 
333 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  32.32 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  30.99 
 
 
333 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  30.91 
 
 
333 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  31.08 
 
 
337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  30.65 
 
 
330 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  30.34 
 
 
330 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  30.86 
 
 
331 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  30.96 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  31.16 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  31.64 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  30.34 
 
 
330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  29.24 
 
 
331 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  29.09 
 
 
338 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  31.1 
 
 
330 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  29.13 
 
 
338 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  29.34 
 
 
328 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 
330 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  31.5 
 
 
333 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  29.27 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  29.27 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  30.79 
 
 
337 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  30.03 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  31.19 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  27.78 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  28.66 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  26.41 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  28.35 
 
 
337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  30.49 
 
 
360 aa  126  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 
328 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  28.17 
 
 
333 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  28.1 
 
 
334 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  25.16 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  28.35 
 
 
333 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  29.88 
 
 
273 aa  89.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.57 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.52 
 
 
315 aa  87  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.85 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.85 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  30.88 
 
 
304 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.85 
 
 
315 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.99 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.29 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.52 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.52 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.52 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.51 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.58 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  27.55 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  29.48 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  26.12 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  30.8 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.32 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  28.04 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.83 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1431  inosine kinase  23.02 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000183569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2845  inosine kinase  24.3 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000469104  decreased coverage  0.00000000256797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  24.73 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  25.34 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  24.83 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.14 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  26.77 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  29 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  26.19 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57331  adenosine kinase  25.42 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  24.05 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  24.38 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  26.13 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  23.49 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>