33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1749 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1749  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0779  hypothetical protein  64.4 
 
 		 193 aa  269  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.128656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0773  hypothetical protein  64.4 
 
 		 193 aa  266  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0360313  normal  0.913908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  27.12 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  28.22 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  27.27 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  26.88 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  32.72 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19960  cytochrome c oxidase accessory protein CcoH  27.11 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  26.88 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  26.79 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  27.54 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  26.67 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  23.95 
 
 		 166 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  29.11 
 
 		 158 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  35.37 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  23.4 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  28.95 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  28.83 
 
 		 159 aa  48.5  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  27.15 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2417  hypothetical protein  23.27 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  22.98 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  25.73 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  30.68 
 
 		 159 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  26.47 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  26.47 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  25.88 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  26.44 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  28.24 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  33.82 
 
 		 159 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  33.82 
 
 		 159 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  33.82 
 
 		 159 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>