More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1733 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  100 
 
 
435 aa  868    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  47.36 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  47.24 
 
 
433 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0593  major facilitator transporter  44.42 
 
 
457 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  32.11 
 
 
435 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  31.6 
 
 
438 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  32.76 
 
 
429 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  32.51 
 
 
429 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  32.51 
 
 
429 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  31.36 
 
 
438 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  32.51 
 
 
429 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  31.24 
 
 
436 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  32.78 
 
 
441 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  32.14 
 
 
466 aa  225  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  30.79 
 
 
432 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  32.14 
 
 
462 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
437 aa  224  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  32.14 
 
 
459 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  31.28 
 
 
445 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  31.28 
 
 
429 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  31.71 
 
 
435 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  31.78 
 
 
448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  29.88 
 
 
433 aa  216  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  31.98 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  33.09 
 
 
442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 
433 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  29.95 
 
 
487 aa  206  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  29.88 
 
 
476 aa  205  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.82 
 
 
433 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  29.88 
 
 
476 aa  205  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  30.99 
 
 
466 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  32.64 
 
 
438 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  31.01 
 
 
458 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  31.01 
 
 
458 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  29.76 
 
 
436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
447 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  30.99 
 
 
430 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  30.99 
 
 
430 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  30.99 
 
 
430 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  30.99 
 
 
430 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  30.99 
 
 
430 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  30.75 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  30.99 
 
 
435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  30.75 
 
 
436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  30.23 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  30.5 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  30.49 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  30.93 
 
 
436 aa  197  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  29.67 
 
 
436 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  31.62 
 
 
438 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  31.33 
 
 
450 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  28.98 
 
 
442 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  30 
 
 
436 aa  193  6e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  27.4 
 
 
435 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  30.46 
 
 
442 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  30.81 
 
 
441 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  31.68 
 
 
441 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  31.08 
 
 
441 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  29.71 
 
 
415 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  29.44 
 
 
387 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  25.9 
 
 
431 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  30.69 
 
 
407 aa  170  6e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  27.15 
 
 
432 aa  168  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  31.08 
 
 
441 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  29.18 
 
 
415 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  30.44 
 
 
438 aa  167  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  30.21 
 
 
443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  31.43 
 
 
433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  28.19 
 
 
447 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  30.09 
 
 
485 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  29.89 
 
 
440 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  30.09 
 
 
485 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  29.62 
 
 
440 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  30.09 
 
 
485 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  31.06 
 
 
485 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  29.62 
 
 
440 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  30.09 
 
 
485 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  29.62 
 
 
441 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  30.09 
 
 
485 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  30.82 
 
 
485 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  29.62 
 
 
440 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  30.09 
 
 
485 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  30.09 
 
 
485 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  27.66 
 
 
429 aa  160  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  28.5 
 
 
441 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  29.62 
 
 
440 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.59 
 
 
442 aa  159  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  28.24 
 
 
440 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  29.35 
 
 
440 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  30.68 
 
 
483 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0793  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
434 aa  156  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  28.37 
 
 
436 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  29.53 
 
 
433 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4306  dicarboxylic acid transport protein  31.67 
 
 
433 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>