204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1727 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1727  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 431 aa  882    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0795  putative ribonuclease D  62.04 
 
 		 432 aa  511  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.16704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0801  3'-5' exonuclease  61.56 
 
 		 380 aa  501  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.963723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  32.8 
 
 		 377 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  32.81 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  32.03 
 
 		 377 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  31.4 
 
 		 377 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  31.2 
 
 		 377 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  33.78 
 
 		 374 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  31.2 
 
 		 377 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  31.55 
 
 		 377 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  29.48 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  31.81 
 
 		 377 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  33.24 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2531  ribonuclease D  30.27 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  31.18 
 
 		 369 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  28.79 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  29.55 
 
 		 371 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1461  ribonuclease D  29.89 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  29.43 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  29.41 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  29.78 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  30.21 
 
 		 375 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01138  ribonuclease D  29.89 
 
 		 385 aa  143  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000796428  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  28.5 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  28.95 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  30.54 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  29.49 
 
 		 367 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  30.43 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  30.27 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  30.27 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  30.27 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0507  ribonuclease D  33.89 
 
 		 374 aa  140  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1626  ribonuclease D  30.65 
 
 		 371 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000103666  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  28.92 
 
 		 384 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  28.92 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  30.03 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  30.16 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  29.72 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  30.45 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  30.27 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1668  ribonuclease D  30.72 
 
 		 369 aa  137  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  29.62 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  29.22 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  29.72 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  29.22 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  29.22 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  29.22 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  29.14 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2124  ribonuclease D  28.25 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0137564  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2402  ribonuclease D  28.25 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2013  ribonuclease D  28.25 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000328628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1994  ribonuclease D  28.12 
 
 		 373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2009  ribonuclease D  27.96 
 
 		 362 aa  133  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  27.69 
 
 		 383 aa  134  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  28.27 
 
 		 375 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  28.27 
 
 		 375 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  28.27 
 
 		 375 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  28.27 
 
 		 375 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  28.27 
 
 		 375 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  28.27 
 
 		 375 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  28.61 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1937  ribonuclease D  29.46 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  28.61 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  28.61 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  28.1 
 
 		 392 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2232  ribonuclease D  28.69 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000142967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  26.86 
 
 		 379 aa  130  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  28.31 
 
 		 384 aa  130  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  28.57 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2088  ribonuclease D  27.69 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227904  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  28.95 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  31.77 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  25.32 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  29.86 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  26.36 
 
 		 382 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  30.83 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  29.45 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  26.5 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  25.92 
 
 		 384 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  29.45 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  29.02 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1064  ribonuclease D (rnase d)  30.22 
 
 		 374 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409138  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1610  3'-5' exonuclease  28.12 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533574  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  31.25 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  28.41 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  29.53 
 
 		 392 aa  124  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  25.93 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  28.32 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  30.88 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2759  ribonuclease D  27.27 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000108089  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  28.89 
 
 		 405 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  31.39 
 
 		 379 aa  120  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  29.25 
 
 		 386 aa  120  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  29.87 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  28.08 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  27.79 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  28.12 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  25.59 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  31.44 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>