136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1712 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  696  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  75.8 
 
 
341 aa  528  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  76.09 
 
 
341 aa  525  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  61.36 
 
 
322 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  61.02 
 
 
322 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  58.53 
 
 
325 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  59.32 
 
 
323 aa  355  9e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  58.19 
 
 
325 aa  353  3e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  54.14 
 
 
322 aa  352  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  53.64 
 
 
323 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  58.64 
 
 
326 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  58.64 
 
 
326 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  7.85059e-07 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  57.63 
 
 
329 aa  344  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  57.97 
 
 
344 aa  343  3e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  59.66 
 
 
323 aa  342  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  51.46 
 
 
349 aa  340  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  58.02 
 
 
321 aa  338  6e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  58.02 
 
 
321 aa  338  6e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  58.02 
 
 
321 aa  338  6e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.85 
 
 
323 aa  337  2e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  57.68 
 
 
321 aa  337  2e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.85 
 
 
323 aa  336  4e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.85 
 
 
323 aa  336  4e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  55.85 
 
 
323 aa  336  4e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.85 
 
 
323 aa  336  4e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.85 
 
 
323 aa  336  4e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  57.34 
 
 
323 aa  335  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  57 
 
 
321 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  55.93 
 
 
349 aa  333  3e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  55.52 
 
 
323 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  54.24 
 
 
324 aa  328  6e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  50.9 
 
 
370 aa  327  1e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  51.54 
 
 
324 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  53.92 
 
 
316 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  53.12 
 
 
317 aa  304  1e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  50.85 
 
 
317 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  50.51 
 
 
317 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.12 
 
 
321 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  49.49 
 
 
317 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  48.16 
 
 
323 aa  292  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  50.68 
 
 
319 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  52.78 
 
 
321 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  46.13 
 
 
321 aa  276  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  45.82 
 
 
321 aa  275  8e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.29 
 
 
327 aa  274  2e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  48.26 
 
 
322 aa  270  3e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  43.12 
 
 
341 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.7856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.12 
 
 
584 aa  256  4e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  42.09 
 
 
325 aa  241  9e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  39.63 
 
 
329 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  40.85 
 
 
324 aa  239  5e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  40.37 
 
 
337 aa  234  1e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  9.3059e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  40.96 
 
 
329 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  37.97 
 
 
337 aa  214  2e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  38.53 
 
 
338 aa  212  6e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  34.97 
 
 
320 aa  209  4e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.17435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  38.13 
 
 
320 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  40.91 
 
 
335 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  37.33 
 
 
322 aa  199  6e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  39.73 
 
 
320 aa  197  2e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  37.97 
 
 
332 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  37.63 
 
 
332 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04583e-09 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  42.45 
 
 
270 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  39.46 
 
 
336 aa  192  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  35.35 
 
 
330 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  36.33 
 
 
340 aa  186  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  36.61 
 
 
313 aa  185  9e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  33.63 
 
 
359 aa  183  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  37.23 
 
 
319 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  32.23 
 
 
331 aa  176  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  31.48 
 
 
334 aa  173  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  33.08 
 
 
331 aa  172  6e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  32.33 
 
 
334 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  31.58 
 
 
331 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  32.06 
 
 
333 aa  169  8e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.38162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  31.02 
 
 
329 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  31.72 
 
 
328 aa  166  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  31.66 
 
 
328 aa  165  1e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.27 
 
 
347 aa  164  2e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.82856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  34.39 
 
 
298 aa  159  5e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  30.12 
 
 
329 aa  155  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  30.84 
 
 
640 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  31.94 
 
 
322 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  27.53 
 
 
327 aa  140  4e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.99 
 
 
352 aa  135  1e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  30.88 
 
 
355 aa  129  1e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  29.29 
 
 
384 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  29.78 
 
 
322 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  27.06 
 
 
320 aa  115  9e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  27.76 
 
 
344 aa  115  1e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  27.51 
 
 
344 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  26.76 
 
 
324 aa  112  1e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  26.33 
 
 
320 aa  109  7e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  27.34 
 
 
365 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  26.6 
 
 
329 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  27.59 
 
 
329 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1481  hypothetical protein  28.18 
 
 
336 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  27.51 
 
 
309 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  27.8 
 
 
297 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.07 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>