123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1684 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 263 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  48.82 
 
 		 270 aa  259  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  49.42 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  36.95 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  34.4 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  31.44 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  32.95 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  31.44 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  32.95 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  32.95 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  38.92 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  32.45 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  37.13 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  37.13 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  32.94 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  32.94 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  32.94 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  32.94 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  37.13 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  32.94 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  32.94 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  32.94 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  32.94 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  31.58 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  32.14 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  33.62 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  34.5 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  31.93 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  32.35 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  31.93 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  31.93 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  31.93 
 
 		 246 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  31.93 
 
 		 246 aa  119  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  31.93 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  31.93 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  31.84 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  28.86 
 
 		 491 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  32.03 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  26.52 
 
 		 497 aa  95.5  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  27.44 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  26.67 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  30.95 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  26.07 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  26.57 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  27.95 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  28.75 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  26.13 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2639  MltA-interacting MipA family protein  29.88 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06020  hypothetical protein  27.31 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3708  MltA-interacting MipA family protein  29.94 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  28.3 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  26.75 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  28.3 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  27.42 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  28.93 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  28.93 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  28.93 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  27.51 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  20.51 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  25.17 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  30.06 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  24.27 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  24.52 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  24.52 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  25.33 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  24.18 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  25.85 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  23.87 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  27.53 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  28.68 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  29.31 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  25.13 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  30.95 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  25.16 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1157  MltA-interacting MipA family protein  25.18 
 
 		 167 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  22.01 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  27.27 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  24.36 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  23.81 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  24.49 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  32.89 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  26.62 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2040  MltA-interacting MipA family protein  37.5 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  26.75 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  25 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  24.4 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  22.41 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  24.15 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  26.45 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1626  MltA-interacting protein MipA  24.86 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.124985  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  30.95 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0649  MltA-interacting MipA family protein  19.42 
 
 		 466 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0235984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  29.55 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  22.45 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  23.27 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>