More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1643 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1643  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 393 aa  815    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  43.15 
 
 		 411 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  44.79 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  35.44 
 
 		 411 aa  233  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  45.17 
 
 		 423 aa  229  9e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  34.96 
 
 		 414 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  43.46 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  43.08 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  43.08 
 
 		 412 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  43.08 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  43.08 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  43.87 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  42.69 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  42.69 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1344  competence/damage-inducible protein CinA  39.31 
 
 		 383 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.827077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1370  competence/damage-inducible protein CinA  39.31 
 
 		 383 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  43.08 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  43.08 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  42.29 
 
 		 412 aa  207  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  38.62 
 
 		 415 aa  206  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  42.21 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  33.66 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  38.8 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0851  competence/damage-inducible protein CinA, putative  36.18 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  38.68 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  39.1 
 
 		 412 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  39.1 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  37.46 
 
 		 416 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  39.13 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  37.22 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  36.14 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 		 408 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  36.6 
 
 		 413 aa  176  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  36.18 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  38.49 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  37.74 
 
 		 418 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  36.33 
 
 		 417 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  33.89 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  40.31 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  34.55 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.78 
 
 		 431 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  33.56 
 
 		 416 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  35.71 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  33.25 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  35.47 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  36.36 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  35.31 
 
 		 406 aa  162  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.41 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.08 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.71 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  36.58 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  36.86 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  34.33 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  32.06 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.65 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  32.87 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  38.46 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  27.51 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  35.36 
 
 		 419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.96 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  34.48 
 
 		 425 aa  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  29.07 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  31.5 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  32.46 
 
 		 430 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  26.51 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  26.57 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  34.62 
 
 		 408 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  34.62 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  30.68 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  31.44 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 438 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  28.72 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  33.33 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  30.03 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  32.16 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  31.68 
 
 		 417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  31.12 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  34.07 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  31.89 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  32.21 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.27 
 
 		 401 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  29.67 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  30.3 
 
 		 423 aa  122  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  31.95 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  31.03 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  31.54 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  26.03 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  32.08 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  30.22 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  30.85 
 
 		 431 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  28.96 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  29.63 
 
 		 417 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  30.71 
 
 		 424 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  29.81 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  30.11 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  30.95 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  29.07 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  30.98 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  27.04 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  31.25 
 
 		 265 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>