More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1600 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1600  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
405 aa  825    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157762  hitchhiker  0.000100305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1503  gamma-glutamyl kinase  77.89 
 
 
390 aa  599  1e-170  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1682  gamma-glutamyl kinase  77.11 
 
 
390 aa  594  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  50.95 
 
 
368 aa  356  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
372 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
374 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  49.87 
 
 
378 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  50.41 
 
 
372 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  50.41 
 
 
372 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
372 aa  349  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  50.41 
 
 
372 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
378 aa  349  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  47.27 
 
 
376 aa  348  7e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  48.1 
 
 
390 aa  347  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  50.41 
 
 
372 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
378 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  50.14 
 
 
372 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
394 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
382 aa  345  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
372 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
372 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
372 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  48.51 
 
 
372 aa  345  7e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
372 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
372 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
372 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 
374 aa  345  8.999999999999999e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
372 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
372 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  49.59 
 
 
372 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  50.82 
 
 
372 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 
379 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  49.46 
 
 
380 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  49.45 
 
 
371 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 
372 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  49.32 
 
 
372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  48.5 
 
 
375 aa  339  5e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
378 aa  338  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  50.53 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  48.78 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  48.1 
 
 
376 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  48.51 
 
 
372 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 
372 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  47.97 
 
 
374 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  49.2 
 
 
380 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  49.2 
 
 
380 aa  332  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  50.82 
 
 
373 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  47.97 
 
 
374 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  47.96 
 
 
375 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  47.7 
 
 
374 aa  328  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  51.09 
 
 
372 aa  328  8e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  50.82 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  50.95 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
372 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3672  gamma-glutamyl kinase  48.92 
 
 
379 aa  323  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.039065  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 
372 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 
372 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  45.5 
 
 
376 aa  318  7e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  47.27 
 
 
376 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  47.27 
 
 
376 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 
372 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 
372 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  48.09 
 
 
373 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  49.19 
 
 
374 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  40.98 
 
 
373 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  44.12 
 
 
376 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
373 aa  289  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  44.59 
 
 
376 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  44.05 
 
 
376 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  40.74 
 
 
383 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  43.78 
 
 
376 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 
374 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  44.83 
 
 
366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 
378 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  43.67 
 
 
379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
369 aa  269  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
373 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 
379 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  42.37 
 
 
387 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  40.22 
 
 
392 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  41.42 
 
 
374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  40.98 
 
 
384 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  40.32 
 
 
376 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  52.57 
 
 
260 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  41.94 
 
 
375 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  41.62 
 
 
370 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  41.42 
 
 
367 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  39.67 
 
 
377 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  42.12 
 
 
376 aa  260  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  41.03 
 
 
387 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
386 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  40.76 
 
 
367 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  41.3 
 
 
367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  40.6 
 
 
372 aa  259  8e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  39.04 
 
 
369 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  40.71 
 
 
367 aa  259  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>