240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1590 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
269 aa  557  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  76.89 
 
 
247 aa  381  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  76.27 
 
 
245 aa  380  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  58.22 
 
 
232 aa  279  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  59.19 
 
 
235 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  56.44 
 
 
233 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  58.3 
 
 
233 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  57.92 
 
 
229 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  55.46 
 
 
243 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  58.77 
 
 
231 aa  263  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  56.7 
 
 
230 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  55.36 
 
 
231 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  56.7 
 
 
230 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  55.36 
 
 
231 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  53.98 
 
 
241 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  55.8 
 
 
230 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  54.67 
 
 
253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  55.36 
 
 
230 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  56.25 
 
 
230 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  54.22 
 
 
253 aa  257  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  53.33 
 
 
261 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  53.74 
 
 
241 aa  256  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  53.54 
 
 
231 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  55.11 
 
 
232 aa  256  3e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  53.98 
 
 
229 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  55.8 
 
 
229 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  56.25 
 
 
230 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  56.11 
 
 
224 aa  254  7e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 
221 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  54.02 
 
 
231 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  55.02 
 
 
230 aa  253  3e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  56.74 
 
 
218 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  54.38 
 
 
224 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  55.61 
 
 
237 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  54.59 
 
 
229 aa  247  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 
229 aa  244  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  55.2 
 
 
220 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  53.78 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  54.13 
 
 
225 aa  243  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  55.3 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  53.1 
 
 
222 aa  242  5e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  51.12 
 
 
245 aa  242  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  55.05 
 
 
223 aa  241  6e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  55.05 
 
 
225 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 
231 aa  241  9e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 
221 aa  241  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 
231 aa  241  9e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  56.22 
 
 
221 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  55.05 
 
 
225 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  55.05 
 
 
226 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 
222 aa  238  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  51.12 
 
 
231 aa  238  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  52.47 
 
 
225 aa  238  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  52.94 
 
 
221 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  52.97 
 
 
268 aa  237  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  52.27 
 
 
221 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  53.67 
 
 
226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  55.14 
 
 
217 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  52.21 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 
223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  54.46 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  54.3 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  54.3 
 
 
228 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  51.83 
 
 
218 aa  232  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  51.58 
 
 
225 aa  232  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  51.58 
 
 
225 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  54.75 
 
 
228 aa  231  8.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  51.8 
 
 
226 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  52.09 
 
 
218 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 
223 aa  231  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  52 
 
 
226 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  52.09 
 
 
218 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  53.21 
 
 
225 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
229 aa  230  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  48.18 
 
 
227 aa  230  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  53.74 
 
 
217 aa  229  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  51.13 
 
 
225 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  51.38 
 
 
225 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 
222 aa  229  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  53.7 
 
 
226 aa  228  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 
228 aa  228  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 
222 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  51.74 
 
 
234 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  50.92 
 
 
225 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  50.92 
 
 
225 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 
229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  51.16 
 
 
222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  53.49 
 
 
229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
216 aa  225  8e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  50.92 
 
 
225 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  50.92 
 
 
225 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 
220 aa  224  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 
229 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 
221 aa  223  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  47.53 
 
 
225 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
222 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  49.08 
 
 
222 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 
219 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  52.94 
 
 
227 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>