More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1586 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1586  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 99 aa  209  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123094  hitchhiker  0.000875712 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1493  putative histone-like DNA-binding protein  71.43 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226015  normal  0.624474 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1672  histone-like DNA-binding protein  71.43 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000757514  normal  0.308061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 		 102 aa  117  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  52.17 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  52.17 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 100 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  47.31 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  47.31 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  47.42 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  51.65 
 
 		 98 aa  106  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 95 aa  105  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  47.31 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  47.31 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  47.31 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  53.85 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  48.39 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  47.31 
 
 		 109 aa  103  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  51.61 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1647  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0979657  normal  0.0681876 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3026  hypothetical protein  53.93 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2884  hypothetical protein  53.93 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  51.65 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  48.94 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1539  integration host factor subunit beta  52.22 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1565  histone-like DNA-binding protein  47.31 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000515528  unclonable  0.0000000000266845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000159286  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1596  integration host factor subunit beta  52.22 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.878202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2071  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2278  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000837765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2067  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000478736  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2395  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000343473  unclonable  0.00000762549 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 98 aa  100  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2297  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000102507  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1955  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000468135  unclonable  0.00000320833 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1307  histone family protein DNA-binding protein  45.36 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.226884  hitchhiker  0.000000648768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000593472  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3012  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0965  integration host factor, beta subunit  45.16 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2245  putative integration host factor beta-subunit (ihf-beta) protein  46.15 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 92 aa  98.6  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1754  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014676  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2256  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2312  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000159711  hitchhiker  0.000000300932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2222  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000109165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2338  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 94 aa  97.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0928  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0924  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  47.31 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2731  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00160452  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1047  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.788464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1015  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.613855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1009  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000570398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  46.24 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0988  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.165109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  46.24 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>