More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1485 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  100 
 
 
777 aa  1599    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  43.82 
 
 
757 aa  555  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  44.54 
 
 
742 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  42.98 
 
 
746 aa  545  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  43.85 
 
 
742 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  41.18 
 
 
759 aa  535  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  43.17 
 
 
703 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  41.3 
 
 
749 aa  515  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  42.39 
 
 
740 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  40.86 
 
 
766 aa  515  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  39.77 
 
 
746 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  39.9 
 
 
746 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  41.49 
 
 
724 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  41.49 
 
 
724 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  41.51 
 
 
724 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  41.35 
 
 
724 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  39.95 
 
 
746 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  39.95 
 
 
746 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  40.72 
 
 
751 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  40.72 
 
 
751 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  40.72 
 
 
751 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  40.29 
 
 
746 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  41.35 
 
 
724 aa  496  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  38.75 
 
 
783 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  39.81 
 
 
746 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  40.44 
 
 
751 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  39.65 
 
 
746 aa  492  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  39.39 
 
 
746 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  39.52 
 
 
746 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  39.79 
 
 
746 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  39.65 
 
 
746 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  40.58 
 
 
751 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  39.52 
 
 
746 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  39.24 
 
 
744 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  38.85 
 
 
744 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  39.86 
 
 
744 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  38.66 
 
 
750 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30 
 
 
665 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  27.9 
 
 
653 aa  212  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  26.86 
 
 
652 aa  212  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  26.42 
 
 
665 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  26.42 
 
 
665 aa  204  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  26.42 
 
 
665 aa  204  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 
662 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 
649 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 
649 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 
681 aa  193  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 
662 aa  193  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 
662 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 
680 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 
652 aa  190  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 
653 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 
648 aa  187  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  27.48 
 
 
650 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  26.8 
 
 
656 aa  187  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  25.19 
 
 
665 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 
661 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 
698 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 
698 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 
698 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  26.88 
 
 
650 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  26.88 
 
 
650 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.88 
 
 
650 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  26.75 
 
 
650 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 
657 aa  178  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.17 
 
 
659 aa  177  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  26.66 
 
 
680 aa  176  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25.24 
 
 
663 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  25.24 
 
 
663 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  25.24 
 
 
641 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 
663 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.24 
 
 
663 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  25.24 
 
 
663 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.1 
 
 
663 aa  173  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 
713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  27.55 
 
 
676 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.03 
 
 
656 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 
714 aa  165  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  25.58 
 
 
700 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  26.53 
 
 
656 aa  161  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  26.26 
 
 
640 aa  160  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
726 aa  158  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  25.16 
 
 
666 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.87 
 
 
666 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.73 
 
 
666 aa  154  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.8 
 
 
663 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.13 
 
 
663 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.73 
 
 
666 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.6 
 
 
666 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.34 
 
 
653 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  26.55 
 
 
702 aa  144  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  26.95 
 
 
572 aa  144  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.54 
 
 
633 aa  144  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  25.53 
 
 
698 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 
698 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  27.13 
 
 
696 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.83 
 
 
635 aa  141  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  23.67 
 
 
697 aa  140  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  26.34 
 
 
732 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  25.13 
 
 
696 aa  139  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>