145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1407 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  100 
 
 
221 aa  460  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  72.04 
 
 
219 aa  328  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  70.62 
 
 
219 aa  324  6e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  40.09 
 
 
210 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  39.35 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  39.35 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  38.43 
 
 
209 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  38.71 
 
 
205 aa  141  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  38.81 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  36.04 
 
 
210 aa  138  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  37.9 
 
 
218 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.13 
 
 
210 aa  134  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  36.49 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  38.65 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  35.75 
 
 
214 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  35.71 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  35.62 
 
 
220 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  37.8 
 
 
211 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  39.05 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  37.86 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  37.62 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  33.63 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.05 
 
 
211 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  37.17 
 
 
219 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  35.1 
 
 
235 aa  123  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  34.07 
 
 
214 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  36.07 
 
 
222 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  37.14 
 
 
211 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  38.32 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  35.62 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  33.18 
 
 
222 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  33.18 
 
 
242 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.63 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  35.38 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  35.32 
 
 
212 aa  118  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  33.78 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  33.93 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  32.86 
 
 
224 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  32.86 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  32.86 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0249  putative transmembrane protein  35.24 
 
 
219 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00045708  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  33.79 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  31.98 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  31.36 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  33.64 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  34.86 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  33.18 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  36.92 
 
 
220 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.18 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  31.82 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.18 
 
 
214 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  31.82 
 
 
225 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  31.82 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.18 
 
 
214 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.18 
 
 
214 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  33.18 
 
 
214 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  31.67 
 
 
219 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  31.82 
 
 
214 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.73 
 
 
214 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.73 
 
 
214 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.82 
 
 
214 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  31.92 
 
 
229 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  33.98 
 
 
217 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  33.01 
 
 
224 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  31.67 
 
 
219 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.45 
 
 
215 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2391  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  36.19 
 
 
219 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  33.5 
 
 
230 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  33.5 
 
 
223 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  31.67 
 
 
218 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  31.67 
 
 
218 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  30.99 
 
 
215 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  31.36 
 
 
214 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  31.36 
 
 
214 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  31.36 
 
 
214 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.36 
 
 
214 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  31.36 
 
 
214 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3367  hypothetical protein  36.19 
 
 
219 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803242  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  32.27 
 
 
214 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  31.36 
 
 
214 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  31.22 
 
 
218 aa  104  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  31.22 
 
 
218 aa  104  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  30.52 
 
 
215 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  33.18 
 
 
220 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  34.47 
 
 
217 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  34.95 
 
 
219 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  34.95 
 
 
219 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  30.93 
 
 
238 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.47 
 
 
241 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2583  putative hydrolase alpha/beta fold  34.08 
 
 
219 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141218  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.27 
 
 
221 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  33.01 
 
 
217 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  30.49 
 
 
223 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  32.11 
 
 
219 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  30.23 
 
 
237 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  27.93 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  29.91 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>