More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1399 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1399  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 
810 aa  1679  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.69789e-05  hitchhiker  0.00375305 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1056  peptidase S16, lon-like  52.29 
 
 
975 aa  610  1e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1322  hypothetical protein  54.09 
 
 
951 aa  611  1e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  34.44 
 
 
803 aa  406  1e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  31.09 
 
 
814 aa  400  1e-110  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  37.68 
 
 
803 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  32.86 
 
 
802 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.98 
 
 
802 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  32.61 
 
 
819 aa  382  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  35.26 
 
 
795 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  32.7 
 
 
799 aa  382  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.88 
 
 
865 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  32.41 
 
 
777 aa  379  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  36.59 
 
 
786 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  31.35 
 
 
798 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.52 
 
 
813 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.05 
 
 
786 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.25582e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  39.33 
 
 
798 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  42.59 
 
 
809 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  40.12 
 
 
844 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  40 
 
 
810 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.74 
 
 
805 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  37.89 
 
 
807 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  38.74 
 
 
805 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.93 
 
 
805 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.34 
 
 
805 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  31.38 
 
 
815 aa  365  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  38.53 
 
 
832 aa  364  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.58 
 
 
810 aa  365  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.88 
 
 
816 aa  364  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  37.85 
 
 
791 aa  363  8e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  38.06 
 
 
800 aa  362  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.51631e-05  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.25 
 
 
843 aa  362  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  34.91 
 
 
809 aa  362  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  37.94 
 
 
805 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  37.75 
 
 
805 aa  361  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.94 
 
 
805 aa  361  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  40.59 
 
 
818 aa  361  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  38.52 
 
 
811 aa  360  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  38.54 
 
 
806 aa  360  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.16 
 
 
812 aa  359  1e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  38.16 
 
 
812 aa  359  1e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  38.16 
 
 
812 aa  359  1e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  37.96 
 
 
812 aa  358  2e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  38.31 
 
 
806 aa  358  3e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  36.13 
 
 
786 aa  357  6e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  38.67 
 
 
817 aa  357  7e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  38.46 
 
 
817 aa  357  7e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  35.57 
 
 
786 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  35.07 
 
 
801 aa  356  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  30.69 
 
 
787 aa  355  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  37.67 
 
 
829 aa  354  3e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  2.80038e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.64 
 
 
805 aa  354  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.75 
 
 
807 aa  354  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  39.92 
 
 
808 aa  354  5e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  38.29 
 
 
795 aa  353  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0590  ATP-dependent protease, putative  35.83 
 
 
811 aa  353  7e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0118699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.14 
 
 
806 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  37.75 
 
 
812 aa  351  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  38.01 
 
 
811 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  39.19 
 
 
861 aa  348  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  38.22 
 
 
660 aa  347  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  37.8 
 
 
811 aa  347  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1447  ATP-dependent protease, putative  38.95 
 
 
806 aa  347  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.66 
 
 
806 aa  346  9e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347497  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  29.75 
 
 
786 aa  346  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  39.45 
 
 
813 aa  344  4e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.51 
 
 
801 aa  344  4e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  37.45 
 
 
827 aa  341  3e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  32.08 
 
 
825 aa  339  1e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  30.97 
 
 
810 aa  338  3e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  32.71 
 
 
821 aa  336  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1288  peptidase S16 lon domain protein  35.63 
 
 
811 aa  335  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  33.92 
 
 
823 aa  334  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  37.55 
 
 
814 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  32.43 
 
 
813 aa  332  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.94 
 
 
788 aa  330  9e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  33.49 
 
 
819 aa  327  4e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  33.12 
 
 
819 aa  327  4e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.45 
 
 
805 aa  325  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2626  ATP-dependent protease, putative  39.23 
 
 
803 aa  325  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.39913e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  35.32 
 
 
831 aa  322  1e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.65888e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  37.39 
 
 
806 aa  322  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  38.02 
 
 
817 aa  318  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  31.98 
 
 
873 aa  315  2e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.99 
 
 
815 aa  315  3e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.24 
 
 
783 aa  314  4e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  32.37 
 
 
811 aa  313  6e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.35674e-05  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  40.09 
 
 
784 aa  310  6e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1037  peptidase S16 lon domain protein  28.19 
 
 
774 aa  310  7e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.350098  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2798  peptidase S16 lon domain protein  37.5 
 
 
811 aa  308  2e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00224654  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2007  ATP-dependent protease, putative  36 
 
 
829 aa  305  2e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.303021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  33.67 
 
 
803 aa  305  2e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.1 
 
 
794 aa  303  7e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.67 
 
 
790 aa  303  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.64 
 
 
794 aa  303  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  35.54 
 
 
797 aa  299  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003444  ATP-dependent protease LA-related protein  35.73 
 
 
546 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.34026e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0350  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.66 
 
 
722 aa  272  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1607  ATP-dependent protease  37.24 
 
 
582 aa  270  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  6.44541e-07  normal  0.0794019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>