91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1388 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  100 
 
 
298 aa  623  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  63.55 
 
 
305 aa  382  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  62.88 
 
 
305 aa  381  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  42.39 
 
 
286 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  37.06 
 
 
297 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  36.12 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  35.35 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  38.87 
 
 
291 aa  198  9e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  36.27 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  36.27 
 
 
276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  35.69 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  35.96 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  36.27 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  35.69 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  35.84 
 
 
276 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  35.76 
 
 
288 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  35.69 
 
 
288 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  35.2 
 
 
288 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  34.88 
 
 
294 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  34.11 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  39.7 
 
 
285 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  40.07 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  42.73 
 
 
285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  35.15 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  35.97 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  40.08 
 
 
285 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  34.35 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  33.45 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  39.92 
 
 
267 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  33.99 
 
 
306 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  36.8 
 
 
284 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  34.8 
 
 
314 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  38.98 
 
 
284 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  36.36 
 
 
296 aa  165  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  38.5 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  34.17 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  38.05 
 
 
285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  40.55 
 
 
283 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  40.36 
 
 
283 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  40.81 
 
 
283 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
284 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  34.11 
 
 
294 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  36.06 
 
 
317 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  34.27 
 
 
284 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  31.06 
 
 
280 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  38.66 
 
 
283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  29.94 
 
 
339 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  32.53 
 
 
305 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  33.68 
 
 
280 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  34.69 
 
 
301 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  32.71 
 
 
300 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  36.4 
 
 
335 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  32.88 
 
 
281 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  32.53 
 
 
281 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  32.53 
 
 
281 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  31.89 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  31.44 
 
 
311 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  31.5 
 
 
320 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  34.1 
 
 
306 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  31.09 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  33.97 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  32.65 
 
 
284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  33.84 
 
 
282 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  31.58 
 
 
335 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  31.66 
 
 
333 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  30.65 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  29.66 
 
 
291 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  29.3 
 
 
297 aa  112  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  22.57 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  24.31 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  22 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0535  putative signal peptide protein  31.58 
 
 
152 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.186468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  34.83 
 
 
141 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  32.26 
 
 
141 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  35.62 
 
 
142 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  37.14 
 
 
142 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  28.74 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  25.37 
 
 
283 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  47.62 
 
 
142 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04370  fatty-acid synthase complex protein, putative  29.41 
 
 
2513 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  34.29 
 
 
142 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  52.63 
 
 
137 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  41.86 
 
 
144 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  36.11 
 
 
143 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  37.14 
 
 
143 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  38.36 
 
 
138 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2915  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  52.38 
 
 
473 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1255  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  52.38 
 
 
473 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  34.85 
 
 
150 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  48.78 
 
 
142 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  42.86 
 
 
157 aa  42.7  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>