243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1322 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  100 
 
 
232 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  51.38 
 
 
241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2920  LrgB family protein  43.66 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0043  LrgB family protein  42.66 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0061  LrgB family protein  42.2 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775871  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0034  LrgB family protein  42.66 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0028  LrgB-like protein  42.2 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0042  LrgB family protein  42.2 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0045  LrgB family protein  42.79 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3226  LrgB-like protein  42.33 
 
 
240 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.144978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4532  lrgB-like family protein  40.81 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.889737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4525  LrgB family protein  40.81 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4616  LrgB family protein  40.81 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  40.54 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  41.2 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4618  LrgB family protein  40.81 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2767  hypothetical protein  39.07 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0025  hypothetical protein  39.07 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3499  hypothetical protein  39.07 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1870  hypothetical protein  39.07 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0027  LrgB-like family protein  39.07 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0026  LrgB-like family protein  39.07 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2682  hypothetical protein  39.07 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0238  hypothetical protein  39.07 
 
 
253 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  38.05 
 
 
228 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  41.71 
 
 
235 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  40.54 
 
 
235 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  37.17 
 
 
228 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4667  LrgB family protein  40.36 
 
 
229 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  40.67 
 
 
231 aa  158  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  40.37 
 
 
236 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  41.23 
 
 
235 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  40.09 
 
 
235 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0830  LrgB family protein  37.86 
 
 
229 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0273  LrgB family protein  39.81 
 
 
229 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0268732  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  38.68 
 
 
225 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1048  hypothetical protein  40.29 
 
 
244 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0892  LrgB family protein  41.4 
 
 
229 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  40.49 
 
 
229 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3049  LrgB family protein  39.81 
 
 
244 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00126242  normal  0.0295055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0976  LrgB family protein  38.89 
 
 
239 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0955  LrgB family protein  38.89 
 
 
239 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0990  LrgB family protein  38.89 
 
 
239 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3388  LrgB family protein  38.89 
 
 
239 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6539  LrgB family protein  37.09 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.198287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0886  LrgB family protein  39.81 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00106123  normal  0.143935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3024  LrgB family protein  37.96 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0923  LrgB family protein  39.81 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.47828  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  35.44 
 
 
230 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  35.19 
 
 
238 aa  141  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  37.75 
 
 
225 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  37.75 
 
 
225 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  37.75 
 
 
225 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  37.75 
 
 
225 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  37.75 
 
 
225 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  37.75 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  34.74 
 
 
230 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  34.27 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  34.27 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  37.25 
 
 
225 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  34.27 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  34.27 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  34.27 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  37.25 
 
 
225 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  37.25 
 
 
225 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  34.27 
 
 
230 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  34.27 
 
 
230 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  34.27 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2616  hypothetical protein  31.11 
 
 
229 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2563  hypothetical protein  31.11 
 
 
229 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  33.18 
 
 
224 aa  134  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  35.02 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  35.78 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  35 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5246  hypothetical protein  37.64 
 
 
195 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3855  hypothetical protein  33.96 
 
 
223 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  35.56 
 
 
239 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  34.5 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0212  LrgB family protein  31.88 
 
 
237 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0099  LrgB family protein  34.5 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0245  LrgB family protein  36.57 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1444  hypothetical protein  33.18 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000188634 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3524  LrgB family protein  32.26 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3765  hypothetical protein  32.69 
 
 
223 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000370937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3598  hypothetical protein  33.17 
 
 
219 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.350738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0900  LrgB-like protein  35.51 
 
 
228 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3884  hypothetical protein  33.17 
 
 
219 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  34.12 
 
 
228 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2926  hypothetical protein  37.86 
 
 
229 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000884331  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  31.84 
 
 
245 aa  122  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0903  LrgB family protein  39.15 
 
 
229 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000464548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  35.45 
 
 
245 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  33.81 
 
 
233 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1949  LrgB family protein  32.39 
 
 
236 aa  121  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2116  hypothetical protein  28.44 
 
 
229 aa  121  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0001189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  31.48 
 
 
230 aa  121  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  33.64 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  32.39 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  35 
 
 
244 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3796  LrgB family protein  37.95 
 
 
240 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>