191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1267 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1365  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  73.59 
 
 
467 aa  635    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000311769  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1267  stearoyl-CoA 9-desaturase  100 
 
 
396 aa  828    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000517428  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0999  stearoyl-CoA 9-desaturase  72.82 
 
 
467 aa  632  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0178  stearoyl-CoA 9-desaturase  54.67 
 
 
368 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0621895  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4079  Stearoyl-CoA 9-desaturase  54.67 
 
 
368 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0467069  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0174  stearoyl-CoA 9-desaturase  54.67 
 
 
368 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.18166  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0176  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  48.57 
 
 
375 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.482981  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  48.86 
 
 
375 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.0270833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4181  stearoyl-CoA 9-desaturase  54.67 
 
 
368 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00992802  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1612  Stearoyl-CoA 9-desaturase  47.06 
 
 
379 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0177  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  48 
 
 
375 aa  347  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0136  stearoyl-CoA 9-desaturase  45 
 
 
368 aa  346  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0276259  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0123  stearoyl-CoA 9-desaturase  45.26 
 
 
369 aa  345  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00541017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0197  fatty acid desaturase family proteiin  47.84 
 
 
368 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3542  stearoyl-CoA 9-desaturase  53.67 
 
 
368 aa  342  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0592044  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0229  stearoyl-CoA 9-desaturase  53.67 
 
 
368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000388622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0162  stearoyl-CoA 9-desaturase  48.91 
 
 
378 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000759757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0191  stearoyl-CoA 9-desaturase  47.67 
 
 
372 aa  332  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.195435  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4712  stearoyl-CoA 9-desaturase  46.67 
 
 
368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0146517  normal  0.30618 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4340  stearoyl-CoA 9-desaturase  46.26 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000789253  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0424  putative fatty acid desaturase  45.14 
 
 
375 aa  325  9e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03581  hypothetical putative delta-9 fatty acid desaturase  44.09 
 
 
375 aa  315  9e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4032  stearoyl-CoA 9-desaturase  46.69 
 
 
375 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0694156  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06094  acyl-CoA desaturase  46.29 
 
 
374 aa  309  6.999999999999999e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1494  stearoyl-CoA 9-desaturase  43.77 
 
 
372 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.190826  normal  0.0846838 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000292  delta-9 fatty acid desaturase  50.17 
 
 
329 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553965  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1023  fatty acid desaturase family proteiin  37.12 
 
 
371 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1153  acyl-CoA desaturase  37.12 
 
 
371 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.881632  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2865  stearoyl-CoA 9-desaturase  39.83 
 
 
393 aa  219  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01180  stearoyl-CoA 9-desaturase, putative  35.23 
 
 
594 aa  219  8.999999999999998e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443597  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70693  stearoyl-CoA desaturase  40.61 
 
 
484 aa  212  9e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441188  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04135  conserved hypothetical protein  36.49 
 
 
449 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513143  normal  0.101908 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06731  Stearic acid desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJU5]  33.98 
 
 
455 aa  176  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  36.94 
 
 
270 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.19 
 
 
280 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.03 
 
 
302 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.33 
 
 
274 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.33 
 
 
274 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4990  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.02 
 
 
307 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.56 
 
 
294 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  36.73 
 
 
272 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2277  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.67 
 
 
285 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.134636  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6429  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.63 
 
 
325 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.5 
 
 
272 aa  142  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.99 
 
 
312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16070  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  36.48 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.11 
 
 
272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.71 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  31.32 
 
 
358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.34 
 
 
272 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4186  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.45 
 
 
303 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2938  stearoyl-CoA 9-desaturase  35.07 
 
 
295 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0213661  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4777  Stearoyl-CoA 9-desaturase  36.02 
 
 
284 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.71 
 
 
330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4191  stearoyl-CoA 9-desaturase  34.05 
 
 
402 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0555236  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2261  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.68 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0125553  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32330  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  33.9 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1607  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.06 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  32.47 
 
 
306 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3991  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.47 
 
 
320 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0660  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.74 
 
 
329 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.85 
 
 
294 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  34.23 
 
 
312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.67 
 
 
278 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.28 
 
 
339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.82 
 
 
303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28797  desaturase delta 9 desaturase  33.92 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18621  Fatty acid desaturase, type 1  34.23 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.05 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18621  Fatty acid desaturase, type 1  33.48 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.702391  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1156  JamB  31.21 
 
 
344 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0281  JamB  30.23 
 
 
344 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2784  fatty acid desaturase family protein  31.21 
 
 
336 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2938  fatty acid desaturase family protein  31.21 
 
 
303 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1959  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.1 
 
 
323 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000202023  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18811  Fatty acid desaturase, type 1  33.33 
 
 
312 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.52562  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17991  Fatty acid desaturase, type 1  33.63 
 
 
314 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0167  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.91 
 
 
321 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28951  Fatty acid desaturase, type 1  34.33 
 
 
321 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0413  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  33.05 
 
 
316 aa  122  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470867  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1271  Fatty acid desaturase, type 1  32.64 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.66 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1907  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.66 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2615  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.65 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26771  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.2 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3960  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.83 
 
 
377 aa  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0636578  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3156  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.3 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2221  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.99 
 
 
287 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.309276  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21421  Fatty acid desaturase, type 1  33.19 
 
 
259 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.661298  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0909  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.38 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2192  stearoyl-CoA 9-desaturase  33.33 
 
 
307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2131  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.99 
 
 
287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1717  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.22 
 
 
287 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.534578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01780  delta 9 acyl-lipid fatty acid desaturase  32.88 
 
 
309 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48736  stearoyl-CoA desaturase  28.32 
 
 
508 aa  113  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.154814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8609  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.77 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  32.06 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0995  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.93 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0932  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.1 
 
 
331 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8743  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.17 
 
 
364 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>