259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1259 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1259  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
215 aa  449  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.19005e-09  normal  0.0127677 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1007  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.26 
 
 
216 aa  304  7e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1358  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.86 
 
 
216 aa  299  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.426968  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.66 
 
 
218 aa  213  2e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.12 
 
 
211 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.52 
 
 
214 aa  191  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  43.54 
 
 
217 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.06 
 
 
214 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.06 
 
 
214 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.59 
 
 
214 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.06 
 
 
214 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.79 
 
 
212 aa  186  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.72 
 
 
212 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.19 
 
 
212 aa  185  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.12 
 
 
214 aa  184  1e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.66 
 
 
210 aa  184  1e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.12 
 
 
214 aa  184  1e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.78 
 
 
214 aa  183  1e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.4 
 
 
217 aa  183  2e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185253  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.33 
 
 
212 aa  183  2e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2662  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.52 
 
 
227 aa  183  2e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0604494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1772  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.4 
 
 
217 aa  183  2e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.382068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.33 
 
 
212 aa  183  2e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.46 
 
 
229 aa  182  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01598  hypothetical protein  43.06 
 
 
218 aa  182  4e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1714  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.06 
 
 
218 aa  182  4e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2002  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.06 
 
 
218 aa  182  4e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000269962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01608  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.06 
 
 
218 aa  182  4e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1991  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.06 
 
 
218 aa  182  4e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.25 
 
 
212 aa  181  5e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.4 
 
 
240 aa  182  5e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.863598  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.67 
 
 
211 aa  182  5e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.54 
 
 
218 aa  182  5e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.20957e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11923  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.44 
 
 
213 aa  181  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1830  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.06 
 
 
218 aa  181  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.31 
 
 
213 aa  181  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1561  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.58 
 
 
218 aa  181  9e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.58 
 
 
218 aa  181  9e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.12 
 
 
214 aa  180  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1810  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.11 
 
 
218 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00431301  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.52 
 
 
224 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  41.86 
 
 
212 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0417  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.98 
 
 
213 aa  180  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.15 
 
 
214 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2606  pyridoxal 5'-phosphate synthase  42.99 
 
 
213 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.65 
 
 
214 aa  179  3e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.79 
 
 
215 aa  179  3e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.65 
 
 
214 aa  179  3e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  2.3808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.65 
 
 
214 aa  179  3e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.65 
 
 
214 aa  179  3e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2378  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.59 
 
 
227 aa  178  5e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.25 
 
 
212 aa  178  5e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.28 
 
 
218 aa  178  5e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.13615  normal  0.054118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2060  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.06 
 
 
213 aa  178  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.93 
 
 
217 aa  177  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0248  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.27 
 
 
221 aa  177  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.19 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.9 
 
 
231 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.19 
 
 
265 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  9.6585e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.19 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.47 
 
 
213 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.19 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.93 
 
 
211 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3147  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.25 
 
 
213 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0321619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.11 
 
 
218 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.574434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1545  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.11 
 
 
218 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.435189  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1618  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.11 
 
 
218 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal  0.71127 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1726  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.11 
 
 
218 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0190742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.11 
 
 
218 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.79 
 
 
217 aa  176  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.47 
 
 
213 aa  176  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.19 
 
 
214 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.01004e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.38 
 
 
213 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2277  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.65 
 
 
212 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.58541e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  39.91 
 
 
212 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.85 
 
 
212 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.47 
 
 
211 aa  175  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.59 
 
 
217 aa  175  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0021  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.47 
 
 
211 aa  174  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.479852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.63 
 
 
213 aa  174  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.33 
 
 
212 aa  174  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182808  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.93 
 
 
211 aa  174  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33810  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.06 
 
 
222 aa  174  1e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.93 
 
 
233 aa  174  1e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0861149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.81 
 
 
210 aa  173  2e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3597  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46 
 
 
223 aa  172  3e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.65 
 
 
212 aa  172  4e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985992  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.12 
 
 
212 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420266  normal  0.0379481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2477  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  39.25 
 
 
212 aa  171  6e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00062859  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1626  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.12 
 
 
212 aa  171  7e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0502858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1702  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.19 
 
 
212 aa  171  8e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.12 
 
 
212 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  39.44 
 
 
239 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.93 
 
 
211 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40 
 
 
211 aa  170  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.47 
 
 
215 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2515  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.65 
 
 
212 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.961854  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.59 
 
 
215 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1770  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.65 
 
 
212 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1807  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.65 
 
 
212 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>