216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1239 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 
346 aa  724    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  79.27 
 
 
329 aa  567  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  79.27 
 
 
329 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  79.08 
 
 
329 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  79.57 
 
 
329 aa  564  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  77.13 
 
 
329 aa  555  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  75.69 
 
 
327 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  65.75 
 
 
332 aa  461  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  63.09 
 
 
328 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  62.78 
 
 
328 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  55.31 
 
 
326 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  51.41 
 
 
336 aa  354  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  52.5 
 
 
323 aa  349  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  41.05 
 
 
323 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  35.11 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  35.11 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  35.11 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  35.11 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  35.11 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  33.54 
 
 
325 aa  213  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  33.96 
 
 
325 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  33.65 
 
 
325 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  33.96 
 
 
325 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  33.96 
 
 
325 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  33.54 
 
 
320 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  33.23 
 
 
328 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  33.64 
 
 
332 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  31.1 
 
 
323 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  31.4 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  31.4 
 
 
323 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  31.33 
 
 
325 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  36.05 
 
 
323 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  30.34 
 
 
323 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  31.48 
 
 
324 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  29.48 
 
 
323 aa  188  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  29.48 
 
 
323 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  29.48 
 
 
323 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  29.48 
 
 
323 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  29.48 
 
 
323 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  29.48 
 
 
323 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  29.94 
 
 
323 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  29.48 
 
 
323 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  29.48 
 
 
323 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  29.79 
 
 
323 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  29.39 
 
 
323 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  29.39 
 
 
323 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  29.48 
 
 
323 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  28.79 
 
 
323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  28.79 
 
 
323 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  28.79 
 
 
323 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  28.79 
 
 
323 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  29.61 
 
 
368 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  29.77 
 
 
332 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  27.51 
 
 
357 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  28.95 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  26.79 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  30.15 
 
 
399 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  34.81 
 
 
311 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  28.72 
 
 
400 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  26.05 
 
 
379 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  25.17 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  29.57 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  28.29 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  29.76 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  27.33 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  24.53 
 
 
387 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  23.64 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  28.48 
 
 
390 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  23.91 
 
 
387 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  27.11 
 
 
315 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  23.4 
 
 
396 aa  106  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  30.57 
 
 
317 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  23.91 
 
 
387 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  23.27 
 
 
388 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  26.21 
 
 
333 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  25.79 
 
 
388 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  23.27 
 
 
388 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  26.23 
 
 
385 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  23.27 
 
 
388 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  22.96 
 
 
388 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  24.52 
 
 
306 aa  102  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  23.6 
 
 
329 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  25.23 
 
 
326 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  25.93 
 
 
391 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  24.24 
 
 
388 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.44 
 
 
438 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  27.13 
 
 
359 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.27 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  25.09 
 
 
345 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  23.38 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  23.72 
 
 
444 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  25.46 
 
 
345 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  25.64 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  25.89 
 
 
388 aa  95.9  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  27.93 
 
 
312 aa  95.9  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  25.64 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  24.9 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  26.42 
 
 
333 aa  92.8  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  30.72 
 
 
363 aa  92.8  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  30.2 
 
 
320 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>