More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1216 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  100 
 
 		 402 aa  838    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  44.85 
 
 		 412 aa  339  5.9999999999999996e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  44.17 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  42.89 
 
 		 420 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  44.26 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  42.82 
 
 		 411 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  44.47 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  42.96 
 
 		 403 aa  323  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  46.29 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  44.17 
 
 		 403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  42.17 
 
 		 398 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  45.5 
 
 		 409 aa  306  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  42.33 
 
 		 407 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  42.79 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  41.61 
 
 		 413 aa  299  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  40.9 
 
 		 429 aa  298  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  42.65 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  42 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  41.44 
 
 		 405 aa  292  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  41.9 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  41.25 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  42.07 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  41.9 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  43.13 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  43.03 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  40.05 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  38.22 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  41.31 
 
 		 394 aa  280  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  41.02 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  39.9 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  39.4 
 
 		 417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  38.89 
 
 		 462 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  37.53 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  38.69 
 
 		 405 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  39.31 
 
 		 404 aa  268  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  39.14 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  39.7 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  39.7 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  38.11 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  37.63 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  38.64 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  39.53 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  37.5 
 
 		 421 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  38.21 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  37.12 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  38.54 
 
 		 403 aa  255  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  39.56 
 
 		 425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  36.62 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  36.36 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  33.65 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  37.53 
 
 		 396 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  36.68 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3377  phage integrase family protein  41.55 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  40 
 
 		 401 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  36.7 
 
 		 419 aa  245  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  36.41 
 
 		 419 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  36.59 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  34.75 
 
 		 409 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1034  phage integrase  36.3 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.288738  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  36.43 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  34.34 
 
 		 404 aa  237  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  37.06 
 
 		 413 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  35.04 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  34.01 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  34.01 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  34.01 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.01 
 
 		 394 aa  234  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.77 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  35.86 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  35.01 
 
 		 396 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  36.98 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  34.66 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2191  Phage integrase  36.27 
 
 		 418 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  35.37 
 
 		 387 aa  229  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.41 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  35.03 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  36.41 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  34.78 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  36.32 
 
 		 404 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  36.32 
 
 		 404 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  34.64 
 
 		 415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  35.57 
 
 		 404 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  35.62 
 
 		 391 aa  225  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  34.79 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  34.98 
 
 		 418 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  36.71 
 
 		 391 aa  222  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  34.88 
 
 		 425 aa  222  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  35.52 
 
 		 396 aa  222  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  34.5 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  35.38 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  34.66 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  35.64 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  34.98 
 
 		 418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  35.54 
 
 		 421 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  33.58 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  35.19 
 
 		 421 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  35.59 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  35.41 
 
 		 404 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  35.01 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  35.07 
 
 		 438 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>