45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1194 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  100 
 
 		 419 aa  832    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  74.33 
 
 		 428 aa  619  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  72.97 
 
 		 428 aa  620  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  72.86 
 
 		 421 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  53.37 
 
 		 433 aa  418  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  50.59 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  48.48 
 
 		 420 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  46.04 
 
 		 421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  46.95 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  43.68 
 
 		 421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  43.86 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  43.78 
 
 		 425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  45.86 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  43.95 
 
 		 421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  43.97 
 
 		 428 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  44.5 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  43.69 
 
 		 428 aa  299  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  43.53 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  44.28 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  44.28 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  44.28 
 
 		 424 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  43.78 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  43.57 
 
 		 382 aa  278  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  41.75 
 
 		 422 aa  263  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  36.08 
 
 		 421 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  36.13 
 
 		 434 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  34.68 
 
 		 436 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  35.66 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  35.71 
 
 		 437 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  37.05 
 
 		 452 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  35.71 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  35.2 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  32.59 
 
 		 427 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  35.42 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  35.98 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  34.43 
 
 		 422 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  33.1 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  36.93 
 
 		 460 aa  193  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  32.47 
 
 		 433 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  24.86 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  22.62 
 
 		 453 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  54.35 
 
 		 52 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  21.58 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  25.13 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  20.22 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>